三阴性乳腺癌(TNBC)是一种具有高死亡率的侵略性乳腺癌。目前，化学疗法是主要的治疗选择，但临床效果仍不令人满意。由城市大学(CityU)生物学家领导的研究小组已经鉴定并鉴定了一组特定的超级增强子，它们可以刺激相关的关键癌症基因的活性。
研究还发现，某些特定的超级增强子的缺失可以减少肿瘤细胞的生长。最新发现可能有助于为TNBC患者发现新的有效药物靶标，以提高其生存机会。
传统上，癌症研究一直专注于鉴定不同类型乳腺癌中的基因突变。相比之下，表观遗传回路如何影响癌症的特征仍然很差。
表观遗传学改变：诱发癌症的另一种方法
基因突变是DNA序列一个或多个部分的变化，而表观遗传学的变化也会改变基因的DNA，但不会改变序列水平。取而代之的是，将特殊标记(称为表观遗传标记)添加到DNA序列中或从中删除，以改变蛋白质在体内的工作方式。超级增强剂中包含特定的表观遗传标记。因此，超增强剂的放松调节(即异常调节)可以诱导癌症驱动蛋白的大量产生并促进癌症的形成。
城大生物医学系的癌症生物学家丽贝卡·钱月明博士和计算生物学家王欣博士共同研究了这些超级增强剂如何影响TNBC细胞。 。他们的发现发表在科学杂志《自然通讯》上，标题为“通过多组学分析在三阴性乳腺癌中定义超级增强剂”。
王博士的团队将21种细胞系的多级表观基因组测序数据与4000多个患者样品的基因表达数据和临床信息相结合，使用多基因组分析的方法进行了深入的数据挖掘，并建立了特定的超级增强子靶标调节剂适用于所有类型乳腺癌的网络。
癌症生长的关键调节剂
我们的综合分析表明，超级增强剂的聚类足以表征乳腺癌的不同亚型。重要的是，基于调控网络，我们确定基因FOXC1是由TNBC特异的超级增强剂驱动的癌症生长和转移的关键调控因子。FOXC1可以预测患者的生存，并有助于制定针对表观遗传回路的治疗策略。”
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