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研究提供了一种有效的方法来挖掘内生真菌的化学多样性

内生真菌是具有生物活性的小分子的有前途的生产者。对内生真菌丹氏青霉基因组的生物信息学分析揭示了43个生物合成基因簇,显示出其产生大量次生代谢产物的强大能力。

然而,该菌株主要在不同的培养条件下仅以高产量产生雷巴托星,这表明大多数基因簇是沉默的。挖掘P. dangeardii中隐性基因簇的努力,包括表观遗传调控和一株多株化合物(OSMAC)方法,都失败了,这可能是由于rubratoxins的高收率。

一些化合物显示出明显的细胞毒性,抗炎或抗氧化活性。通过生物信息学分析和途径特异性转录因子的过表达来挖掘用于氮杂苯醌生物合成的有吸引力的双重PKSs基因簇。这项研究提供了一种有效的方法来挖掘内生真菌的化学多样性。通过删除用于维甲酸的生物合成关键基因并优化培养条件的代谢分流策略,成功激活了编码其他聚酮化合物合酶(PKS)的多个沉默基因,并导致了可检测到的痕量化合物。结果,作者能够鉴定出总共23种新化合物,包括氮杂苯甲酮单体,二聚体,具有前所未有的多环桥联杂环和螺旋结构的三聚体,以及铁载体。

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