很多人随身携带手消毒液，需要时随时挤出揉搓。但不应该忽视的是，流动水和肥皂洗手永远是无法替代的，也是去除手上沾染的病原微生物的最佳方式。虽然含酒精手消毒液可杀灭绝大多数已知的病原微生物，但它不能清洁手部，且对艰难梭菌、隐孢子虫、诺如病毒、某些肠道病毒等无效，因此洗手至关重要。
有些情况，只能用肥皂和流动水洗手：1.准备食物之前、期间和之后;2.吃东西之前;3.照顾呕吐或腹泻病人前后;4.治疗伤口前后;5.如厕后;6.换尿布后或是给用过卫生间的孩子清洁后;7.接触动物、动物饲料或动物粪便后;8.处理宠物食品后;9.接触垃圾或化学品后;10.手明显脏污或油腻时;11.接触难辨梭状芽胞杆菌、诺如病毒、隐孢子虫、某些肠道病毒感染的患者后。如果身边没有肥皂和水，可使用酒精含量至少为60%的手消毒液，并尽快用肥皂和流动水洗手。
在医院或疗养院看望朋友或亲人前后，可用手消毒液替代肥皂和流动水洗手。但需注意，成人使用手消毒液应至少取用3毫升，经测算，应按压2泵，悬挂式手消毒液分配器也要2泵。
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