导读 密切相关的动物物种在物理上可能看起来不同，但您可能会惊讶地发现，这些差异不仅是由于改变蛋白质结构或功能的 DNA 序列变化造成的，而...
密切相关的动物物种在物理上可能看起来不同，但您可能会惊讶地发现，这些差异不仅是由于改变蛋白质结构或功能的 DNA 序列变化造成的，而且还因为 DNA 的变化会影响这些蛋白质的表达方式。除此之外，并非物种之间的所有差异都可以仅用 DNA 序列变化来解释。
分子生物学家、生物化学助理教授 Emily Hodges 研究我们基因组的调控元件，并对解析 DNA 序列的变化如何影响基因调控感兴趣。
基因的表达受到DNA序列调控元件(例如基因增强子)的控制，这有助于增加靶基因的表达。
增强子功能的物种特异性变化可能是由于 DNA 序列变化直接发生在单个增强子 (顺式) 内或在细胞环境内以影响数千个增强子 (反式) 的方式引起的。例如，转录因子(一种驱动靶基因表达的移动蛋白)是一种反式调控元件，可以结合和控制不同染色体上的增强子。
从历史上看，科学家们很难确定这两种机制对基因表达差异的个体贡献。
Hodges 和前同事 Tony Capra(现任加州大学旧金山分校流行病学和生物统计学副教授)的实验室使用 ATAC-STARR-seq(一种由 Hodges 实验室开发的基因组规模报告技术)来解开这一谜团。顺式和反式调节机制对密切相关的人类和恒河猴之间基因调节差异的相对贡献。论文《人类基因调控进化是由顺式和反式调控元件功能的差异驱动的》于 2024 年 4 月发表在《细胞基因组学》杂志上。
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