预测免疫检查点阻断免疫治疗反应的数据门户

由范德比尔特大学医学中心生物统计学家团队建立的一个名为 Cancer-Immu 的新数据门户可以帮助癌症临床医生和研究人员预测哪些患者会对免疫检查点抑制剂产生反应。Cancer-Immu 拥有来自 16 种癌症类型的 3,652 个样本的数据，是探索免疫基因组连接的最大的免疫检查点阻断相关数据门户。

该团队在 12 月 13 日发表于癌症研究的论文中提供了有关开放访问门户的详细信息。Cancer-Immu 整合了大规模多维组学数据，包括遗传、批量和单细胞转录组、蛋白质组和动态基因组图谱。它还整合了临床表型。

虽然免疫检查点抑制剂可以挽救一些癌症患者的生命，但大多数患者对免疫疗法没有反应。研究人员正在努力识别预测反应的生物标志物，Cancer-Immu 为解开免疫基因组连接提供了一个全面的功能门户。

“它提供了对免疫原性数据的便捷访问，并使研究人员能够将组学数据集转化为生物学见解和临床应用，”VUMC 生物统计学系主任、癌症研究和癌症研究中心 Harold L. Moses 主席 Yu Shyr 博士说。该论文的资深作者之一。根据生物统计学副教授和该论文的另一位资深作者 Qi Liu 博士的说法，“与具有免疫检查点阻断反应结果的现有数据库相比，Cancer-Immu 涵盖了最多数量的数据集和组学数据类型。”

数据门户中的癌症类型包括黑色素瘤、非小细胞肺癌、转移性尿路上皮癌、肾细胞癌、膀胱癌、神经胶质瘤、结直肠癌、头颈癌、食管胃癌、原发性不明的癌症、胃癌、乳腺癌、肝细胞癌、前列腺癌、基底细胞癌和非黑色素瘤皮肤癌。

借助 Cancer-Immu 门户，临床医生和研究人员可以上传和分析他们自己的数据或同时与现有数据进行共同分析。他们可以使用荟萃分析或泛癌分析。该门户网站收集了三种组学数据：遗传、转录组学和单细胞数据。泛癌模块将多个数据集聚合为一个，增强了对稀有特征的检测和分析。生物统计学家在研究中指出，虽然荟萃分析(针对同一问题的独立研究的统计评估)未能检测到显着的基因突变，但泛癌分析(对多种癌症类型进行更广泛的评估)检测到 182突变基因与免疫检查点抑制剂显着相关。

“Cancer-Immu 有助于解决评估已知生物标志物的功效和发现新特征的不足和挑

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