全世界有超过 3500 万人感染了这种病毒，每年有近 200 万新病例，艾滋病毒仍然是一种主要的全球流行病。虽然抗逆转录病毒疗法 (ART) 可以控制感染，但受 HIV 感染的休眠免疫细胞会持续存在于全身的某些组织中，如果 ART 被中断，它们会重新发挥作用。这种潜伏的病毒库是开发 HIV 治愈方法的主要挑战。
为了更好地了解 HIV 持续存在的机制和病理学，研究人员，包括 BIDMC 病毒学和疫苗研究中心的首席研究员 Sizun Jiang 博士，开发了一种新方法，使团队能够表征病毒库和免疫与未感染的对照组织相比，感染 SIV(一种相关病毒)的组织内的反应。这样做揭示了受感染和未感染组织之间的差异，这使科学家们能够提出一个模型来说明 SIV 感染抑制免疫反应的机制。
“目前研究病毒组织库的方法通常需要将细胞从其原生组织环境中取出，”主要作者江说，他在斯坦福大学开始这项工作并在 BIDMC 完成了这项工作。“我们的技术使我们能够原位表征蛋白质分子，这对于开展病毒感染及其他方面的研究至关重要。”
结合其他成像技术，该团队使用 PANINI(蛋白质和核酸原位成像)，它利用抗体来量化组织隔间内的 DNA、RNA 和蛋白质水平，以测量来自健康或 SIV 的档案淋巴组织中的 30 多种组织特征。感染的非人类灵长类动物。该技术有助于揭示组织微环境中的 11 个不同区域或细胞邻域。当研究人员比较健康组织和受感染组织之间的这些邻域时，这些差异证实了逆转录病毒感染的众所周知的特征，并使科学家们能够开发一种机器学习模型来预测病毒激活。
“基本问题仍然存在，未来的原位工作对于提高我们对病毒感染及其他方面的理解至关重要，”江说。“我们预计 PANINI 与其他广泛采用的成像策略相结合，代表了向前迈出的一大步，以推进更好地指导治疗干预策略所需的洞察力。”
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