tRNA 衍生片段的甲基化调节膀胱癌中的基因沉默活性

Anindya Dutta, MBBS, Ph.D. 及其同事描述了一种在膀胱癌中发生改变的新型基因调控，从而促进了一种基因通路，帮助癌细胞在快速生长过程中存活。

他们的工作重点是转移 RNA 的 22 个碱基片段，称为 tRF-3b，它由​​一种称为 TRMT6/61A 的酶复合物修饰。在膀胱癌中，TRMT6/61A(一种将甲基添加到 tRF-3bs 的第四个碱基上的甲基转移酶)的水平升高。这种修饰可防止 tRF-3bs 沉默癌细胞中未折叠蛋白质反应途径中各种基因的表达，从而导致这些基因的表达增加。

“据我们所知，这是第一个基于 N1-甲基腺苷修饰的 TRMT6/61 调节 microRNA 样基因沉默的例子，我们的报告提供了一种机制，通过这种机制可以看到 TRMT6/61A 的升高。在癌症中可以影响基因表达，”杜塔说。“快速增殖的癌细胞比正常细胞合成和折叠更多的蛋白质，因此需要上调未折叠蛋白质反应途径以维持蛋白质稳态。我们发现膀胱癌细胞激活促存活未折叠蛋白质反应以减轻内质网压力的一种方式是通过阻止 tRF 沉默参与这种未折叠蛋白质反应的基因的表达。”

“未折叠的蛋白质反应与癌症进展的许多方面密切相关，并已成为一个有希望的治疗靶点，”Dutta 说。“之前已经注意到，在包括膀胱癌在内的几种癌症类型中，未折叠蛋白反应相关基因在全球范围内上调，因此我们的研究结果表明，抑制 TRMT6/61A 酶可能是治疗膀胱癌的一种新方法。”

Dutta 和共同通讯作者 Rune Ougland 医学博士的研究包括分析从接受经尿道膀胱肿瘤切除术的患者获得的膀胱癌组织。它发表在《自然通讯》杂志上。Dutta 是阿拉巴马大学伯明翰分校遗传学系主任，Ougland 是挪威奥斯陆奥斯陆大学医院 Rikshospitalet 的泌尿外科医生和高级研究研究员。

该研究的一个重要进展是用于从具有 N1-甲基腺苷修饰或 m1A 的人类细胞中创建文库的工作流程。该工作流程结合了两种独立的方法——通过 m1A 抗体进行富集，然后是通过测序进行小 RNA 测序和 m1A 诱导的错配特征。

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