2021年1月2日整理发布：由于其刺突 (S) 蛋白和宿主受体结合域 (RBD) 中存在大量基因组突变，SARS-CoV-2 Omicron 变体被宣布为关注变体 (VOC)。在 Omicron 变体出现后，全球许多国家报告了病 () 病例激增。
Omicron 的一个亚系 BA.2 的出现，其突变略有变化，并且关于 SARS-CoV-2 Omicron 变体的流行病学特征的信息有限，因此需要进行更多的研究。
关于研究
在本研究中，作者对 SARS-CoV-2 Omicron 变体进行了计算机模拟和流行病学相关分析。为此，他们确定了 Omicron 变体突变对宿主-病毒相互作用的功能影响以及 Omicron 相对于特定 SARS-CoV-2 变体的流行病学优势。当前的研究集中在 Omicron BA.1 的当前和最流行的亚系上。
将在硅片分析中使用从上共享所有流感数据的全球倡议(全球共享禽流感数据倡议组织)最高收集54个国家的Omicron变异的3,604基因组序列，以12月10日，2021年的数据是用来确定奥米克的突变对毒性功能的影响、免疫逃逸和病毒传播。使用 hCoV-19/Wuhan/WIV04/2019 作为突变分析的参考菌株，生成了具有氨基酸变化的 Omicron刺突蛋白的三维 (3D) 结构。RBD 相关突变是使用开放分析管道确定的，该管道将酵母展示平台与深度突变扫描相结合。该管道确定了与野生型 (WT) SARS-CoV-2 菌株相比，Omicron RBD 的氨基酸突变对血管紧张素转换酶 2 (ACE2) 结合亲和力和蛋白质表达的影响。
随后，从 2021 年 10 月 1 日至 2021 年 12 月 10 日，对包括 Omicron 在内的 SARS-CoV-2 变异体的基因组序列的相对比例与最近的 病例和来自 SA 的死亡率数据进行了比较分析。这种流行病学相关性进行了研究以了解与现有的 SARS-CoV-2 变体相比，Omicron 变体在毒力或传播性方面是否具有任何流行病学优势。2019 年病 () 的全球流行病学数据来自 Worldometer 数据库。
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