数据驱动科学的开源工具
知识共享是科学进步的重要动力。EPFL的“蓝色大脑项目”采用开放的科学方法创建并开源“蓝色大脑Nexus”,允许构建数据集成平台。Blue Brain Nexus通过搜索、集成和跟踪大规模数据和模型,实现数据驱动的科学。
EPFL的蓝色大脑项目宣布发布其开源软件项目“蓝色大脑连接系统”,旨在实现神经科学和更广泛的科学界的公平(可搜索、可访问、可互操作和可重用)数据管理原则。它是EPFL开放科学计划的一部分,旨在最大限度地扩大学校研究的范围和影响。
蓝脑项目的目的是为啮齿类动物的大脑以及最终人类的大脑建立精确的、生物学上详细的数字重建和模拟。Blue Brain Nexus在支持Blue Brain数据驱动建模周期的所有阶段发挥作用,包括但不限于实验数据、单细胞模型、电路、仿真和验证。大脑是一个复杂的多层次系统,也是我们今天最大的“大数据”问题之一。因此,Blue Brain Nexus旨在组织、存储和处理异常大量的数据,并支持大量用户的使用。
Blue Brain Nexus的核心是知识地图,作为数据仓库和元数据目录。通过允许用户设计任何领域,它仍然独立于要表示的领域,这使得其他科学程序(如天文学、医学研究和农业)能够使用Blue Brain Nexus作为其数据平台的核心。蓝脑Nexus服务已经在评估是否可以集成到人脑项目的神经信息学平台中。
Blue Brain Nexus的知识图谱致力于科学进步的贡献,其起源被视为一等公民,从而推动了对数据源和使用模式的追踪。这使用户能够评估数据质量,从而建立信任。Blue Brain Nexus的另一个关键功能是它的语义搜索功能,可以将搜索与数据及其来源整合在一起,让科学家可以轻松发现和访问新的相关数据。
EPFL大学教授肖恩希尔说:“我们看到几乎所有的科学都是由数据主导的。Blue Brain Nexus代表了多年的研究成果,旨在构建最先进的语义数据管理平台。我们迫不及待地想看看社区将如何使用Blue Brain Nexus。”
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