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新技术可实现生物标志物的超快速鉴定

导读柏林查理特大学和弗朗西斯克里克研究所的研究人员开发了一种基于质谱的技术,可以在几分钟内测量包含数千个蛋白质的样本。它比传统的血细胞

柏林查理特大学和弗朗西斯克里克研究所的研究人员开发了一种基于质谱的技术,可以在几分钟内测量包含数千个蛋白质的样本。它比传统的血细胞计数更快、更便宜。为了证明这项技术的潜力,研究人员使用了从新冠患者身上采集的血浆。他们利用新技术鉴定了11种以前未知的蛋白质,这些蛋白质是疾病严重程度的指标。研究成果已在《自然生物技术》发表。

在任何给定的时间,成千上万的蛋白质在人体内活跃,提供它们的结构,并使生命的基本反应得以实现。人体可以根据需要增加和减少特定蛋白质的活性水平,包括对病原体和药物等外部因素做出反应时。因此,在细胞、组织和血液样本中发现的蛋白质的详细模式可以帮助研究人员更好地理解疾病或做出诊断和预后。为了获得这种“蛋白质指纹”,研究人员使用了质谱仪,这是一种耗时且昂贵的技术。基于质谱的新技术扫描小水线面双体船有望改变这种状况。这项技术是在查理特生物化学研究所所长马库斯拉尔泽教授的领导下开发的。

“为了改变这项技术,我们改变了质谱仪的电场。生成的数据非常复杂,人类无法再对其进行分析。”爱因斯坦的罗勒教授说,他也是弗朗西斯大学的校长。伦敦克里克学院。他补充道:“因此,我们开发了基于神经网络的计算机算法,并利用这些数据提取相关的生物信息。这使我们能够并行识别数千个蛋白质,并大大减少了测量时间。幸运的是,这种方法有更多的优势。准确。”

这项高通量技术具有广泛的潜在应用,从基础研究和大规模药物开发到生物标志物鉴定,可用于估计每个患者的风险。研究人员对新冠的研究证明了这项技术对后者的适用性。作为这项研究的一部分,研究小组分析了30名不同严重程度的新冠住院患者的血浆样本,并将获得的蛋白质模型与15名健康个体的蛋白质模型进行了比较。单个样品的实际测量只需几分钟。

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