EMBL与DeepMind合作预测人类蛋白质的3D结构
2021年7 月 22 日——Google Health 的 DeepMind 宣布与欧洲分子生物学实验室 (EMBL) 建立合作伙伴关系,为科学界提供对迄今为止开发的最全面的 3D 蛋白质结构预测数据库的开放访问。
免费数据库包括基于人类基因组表达的 20,000 种蛋白质的超过 350,000 种蛋白质结构预测。确定蛋白质如何“折叠”并形成其 3D 结构是确定其功能的重要步骤,这是每个生物过程的基础。
该数据库采用人工智能 (AI) 技术开发,旨在帮助各个领域的研究人员加快工作速度。例如,科罗拉多大学博尔德分校的一个团队正在使用预测的蛋白质结构来研究抗生素耐药性,而加利福尼亚大学旧金山分校的一个团队正在使用它们来阐明 SARS-CoV-2 生物学,DeepMind 在一份报告中说释放。
DeepMind 的创始人兼首席执行官 Demis Hassabis 博士说:“我们在 DeepMind 的目标一直是构建人工智能,然后将其用作工具来帮助加快科学发现本身的步伐,从而促进我们对周围世界的理解,”在声明中。
驱动数据库的人工智能技术被称为 AlphaFold,它是由 DeepMind 开发的,去年被蛋白质结构预测小组的批判性评估认可为 50 年来确定蛋白质如何从氨基酸折叠成它们的挑战的重大突破。 3D 结构。
根据 EMBL 总干事 Edith Heard 博士的说法,AlphaFold 数据库是开放科学良性循环的一个例子。
“AlphaFold 是使用科学界建立的公共资源中的数据进行训练的,因此其预测公开是有意义的。公开、自由地分享 AlphaFold 预测将使世界各地的研究人员能够获得新的见解并推动发现,”赫德说。
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