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基因组研究揭示了遗传性视网膜疾病的不同人群

导读 由加州大学圣地亚哥分校的科学家和加州大学圣地亚哥分校健康中心 Shiley Eye Institute 的科学家领导的国际研究团队拓宽并加深了对遗传

由加州大学圣地亚哥分校的科学家和加州大学圣地亚哥分校健康中心 Shiley Eye Institute 的科学家领导的国际研究团队拓宽并加深了对遗传性视网膜营养不良 (IRD) 如何影响不同人群的理解,并在此过程中,确定了可能导致疾病的新基因变异。

该研究结果发表在 2021 年 10 月 18 日的PLOS Genetics 上。

IRD 是一组疾病,从色素性视网膜炎到无脉络膜血症,会导致进行性视力丧失,甚至失明。每个 IRD 至少由一个基因突变引起,尽管同一基因的突变可能导致不同的 IRD 诊断。

IRD 很少见,但它们影响所有年龄段的人,以不同的速度发展,即使在患有相同疾病的家庭中也是如此。具体诊断取决于发现遗传致病突变。

美国食品和药物管理局已批准基因疗法来治疗一种涉及 RPE65 基因的 IRD,但对于由 280 多个不同基因突变引起的其他 IRD,尚无治愈方法或治疗方法被证明可以减缓疾病进展。

研究人员对来自 108 个不相关家族谱系的 409 人进行了全基因组序列 (WGS),每个人都有先前诊断出的 IRD。WGS 是确定个体 DNA 序列的全部或接近全部的过程。它提供了一个人的整个基因组的全面画像,包括突变和变异,可用于广泛的比较目的。

研究参与者来自三个不同的地理区域:墨西哥、巴基斯坦和居住在美国的欧洲裔美国人。从所有参与者的血液样本中进行基因组分析,揭示了 108 个谱系中 62 个谱系的致病变异。在 62 个家族中总共发现了 94 个基因变异:52 个变异以前被确定为致病基因,42 个没有。令人惊讶的是,超过一半的新变体没有被列入基因组聚合数据库,这是一个国际基因组数据汇编。

总体而言,在 63% 的墨西哥参与者、60% 的巴基斯坦参与者和 48% 的欧洲美国人中检测到了致病变异。

该研究还确定了大量特定于研究人群的新 IRD 致病突变,并揭示了导致遗传性视网膜营养不良的突变类型。大约 13% 的家族在基因组中表现出非典型或意外的变化。五个家族谱系在所有受影响的个体中都发生了不止一种基因的突变;一个家庭在不同的基因在不同的受影响的成员进行突变和从头突变是在一个病人时不存在于双方父母发现。

另有 8% 的家族基因组结构发生较大变化,导致遗传性视网膜疾病,四个家族的初步临床诊断根据其基因型重新分类。

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