导读 莱斯大学的计算机科学家将充分利用新技术对单个细胞的基因组进行测序并破译肿瘤中的奥秘。Luay Nakhleh 最近被任命为赖斯布朗工程学院的
莱斯大学的计算机科学家将充分利用新技术对单个细胞的基因组进行测序并破译肿瘤中的奥秘。
Luay Nakhleh 最近被任命为赖斯布朗工程学院的威廉和斯蒂芬妮病院长，他获得了一项为期四年、价值 120 万美元的国家科学基金会资助，用于分析单个癌细胞集落中的基因组，以发现不仅是疾病的根源，以及随着肿瘤的生长它们如何从一个细胞进化到另一个细胞。
Nakhleh 也是计算机科学和生物科学教授，他的团队将使用德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心同事提供的单细胞 DNA 数据。他们希望揭示癌症突变的进化树，最终可以帮助改进对患者的治疗。
“我在进化生物学方面做了很多与癌症无关的工作，”Nakhleh 说。“但我们解决这个问题的方法是进化的，因为我们正在研究我们知道从祖先细胞进化而来的细胞。癌症是由细胞中的单核苷酸变异和拷贝数畸变等突变引起的，但当该细胞的后代发生自身突变时，往往会出现并发症。
“因为它们来自一个单独的细胞，所以它们产生了一种进化树结构，”他说。“这非常令人兴奋，因为我们可以将我们在计算进化生物学方面的专业知识应用于这个特定问题。”
Nakhleh 说，肿瘤中的细胞通常包含多种突变。“在一组具有突变特征的细胞中，你会看到一种聚类：一组细胞有五个特定的突变，另一组有七个等等，”他说。
癌症生物学家想了解这在患者的治疗结果中扮演什么角色，这很难做到。现在我们获得了单细胞分辨率，我们可以在更大范围内识别突变并将它们映射到进化树上。这将帮助我们了解突变发生的顺序。”
标签： 癌症突变
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