根据国际研究联盟的一项新研究，每个城市都有自己独特的微生物组，即独特识别病毒和细菌的“指纹”，该研究组包括马里兰大学医学院(UMSOM)的一个团队。这个国际项目对从全球60个城市的公共交通系统和医院收集的样本进行了测序和分析，今天发表在《细胞》杂志上。
该研究被认为是有史以来全球最大的城市微生物群宏研究，涵盖多个城市的空气和地表。它具有对所有鉴定出的微生物种类的全面分析-包括数千种病毒和细菌以及参考数据库中找不到的两种新近鉴定出的单细胞生物。
研究合著者Lynn Schriml，博士，UMSOM基因组科学研究所(IGS)流行病学与公共卫生学系副教授，领导了巴尔的摩过境系统的研究抽样工作。她说：“巴尔的摩独特的微生物特征揭示了一个独特的，令人着迷的，多样化的世界，提供了对地理变异和以前未知的微生物基因组的见解。”
研究高级作者克里斯托弗·梅森(Christopher Mason)博士，威尔康奈尔大学(Will Cornell Medicine)教授，世界定量预测倡议组织(WorldQuant Initiative for Quantitative Prediction)的负责人补充道：“每个城市都有定义其微生物的'分子回声'。如果您给我穿上鞋子，我可以以大约90%的准确率告诉您您所来自的世界城市。”
该研究是在大流行关闭世界各地的城市之前进行的，因此研究人员现在正在研究大流行如何影响每个城市的微生物组指纹。施里默说：“这是一个很好的问题，我们将在后续研究中解决这个问题。”该联盟于2020年启动了MetaCOV项目，以调查城市元基因组的变化，并分离出SARS-CoV-2病毒(引起的病毒)在城市环境(例如ATM机，废水，医院，公交系统)中的存在)。
最新研究的结果是基于对过去三年来对六大洲城市的4,728个样本进行的分析得出的，这些样本代表了全球第一个系统的城市微生物生态系统目录。除了在各个城市中具有明显的微生物特征外，分析还揭示了一组核心的31种物种，这些物种在整个采样城市地区的97%的采样中都被发现。研究人员确定了4,246种已知的城市微生物，但他们还发现，任何后续采样仍可能会继续发现以前从未见过的物种，这凸显了与等待城市环境中的微生物多样性和生物功能有关的发现的潜在潜力。 。
将来，该发现还具有许多潜在的实际应用，包括确定可用作抗生素的潜在新化合物以及由生物合成基因簇(BGC)注释的具有开发药物前景的小分子。
标签： 细菌微生物
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