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UVA开发抗癌新工具 推进基因组学研究

弗吉尼亚大学医学院的科学家们开发了重要的新资源,这些资源将有助于抗击癌症并推进前沿的基因组学研究。

UVA的Chongzhi Zang博士及其同事和学生们开发了一种新的计算方法,可以根据实验数据在三个维度上绘制染色体的折叠模式。这很重要,因为染色体内部遗传物质的配置实际上会影响我们基因的工作方式。在癌症中,这种配置可能会出错,因此科学家们希望了解健康细胞和癌细胞的基因组结构。除了推进医学研究的许多其他领域之外,这将帮助他们开发更好的方法来治疗和预防癌症。

Zang及其同事和学生已经使用他们的新方法发掘了有用数据的宝库,并且正在将其技术和发现提供给他们的同行科学家。为了推进癌症研究,他们甚至建立了一个交互式网站,将他们的发现与来自其他资源的大量数据结合在一起。他们说,他们的新网站bartcancer.org可以为癌症研究人员提供“独特见解”。

UVA公共卫生中心的计算生物学家Zang说:“基因组的折叠模式具有很高的动态性;它的变化频繁,并且在细胞之间也有所不同。我们的新方法旨在将这种动态模式与基因活性的控制联系起来。”基因组学和UVA癌症中心。“更好地了解这一联系可以帮助阐明癌症和其他疾病的遗传原因,并可以指导精密医学的未来药物开发。”

在BART上下注

Zang绘制基因组折叠图的新方法称为BART3D。从本质上讲,它会将有关一个染色体区域的可用三维结构数据与许多邻近区域进行比较。然后,可以使用这种比较方法推断出这些结果,使用他们最近开发的一种新颖算法“结合转录调控的结合分析”或BART来填补遗传物质蓝图中的空白。结果是一张图谱,为我们的基因如何与控制其活性的“转录调节因子”相互作用提供了前所未有的见识。识别这些调节剂有助于科学家了解打开和关闭特定基因的原因-它们可用于抗击癌症和其他疾病的信息。

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