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蛋白质片段识别出两种新的极端微生物
完美适应的微生物生活在从深海海沟到山顶的极端环境中。更多地了解这些极端微生物如何在恶劣的条件下生存,可以让科学家了解地球上的生命和其他行星上潜在的生命。
在《蛋白质组研究杂志》中,研究人员详细介绍了一种基于蛋白质片段而不是遗传物质来更准确地识别极端微生物的方法。该研究从智利高海拔湖泊(类似于早期火星的环境)中发现了两种新的耐寒细菌。
尽管人类倾向于避免在极热、极冷或高海拔地区定居,但一些微生物已经适应了在如此恶劣的地方生活。这些极端微生物引起了在其他行星上寻找生命的天体生物学家的兴趣。
研究人员目前使用个体基因测序来根据 DNA 识别地球上的微生物。然而,目前的方法无法区分密切相关的极端微生物物种。因此,拉尔夫·莫勒(Ralf Moeller)及其同事研究了是否可以通过使用其蛋白质特征而不是基因序列来识别极端微生物。
研究人员开始使用来自智利高原海拔超过 2.3 英里的五个高海拔安第斯湖泊的水样进行演示。(作为参考,丹佛海拔约一英里。)研究人员从样本中培养了 66 种微生物,然后确定两种方法中哪一种能更好地识别微生物:
传统的基因测序将每个样本的 16s rRNA 基因(基于序列的微生物分析的典型基因)的核苷酸与数据库进行比较以进行识别。
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