独特的基因特征可以帮助预测对化疗的反应
弗朗西斯·克里克研究所的研究人员开发了一种方法,可以帮助预测肺癌患者是否会对化疗产生反应,这取决于肿瘤中哪些基因被激活。
近年来,癌症研究人员加深了我们对特定基因突变如何影响肿瘤发展、进化和对治疗的反应的理解。然而,仅存在突变并不能提供肿瘤生物学的完整图景。
在本周发表在《自然通讯》上的研究中,科学家们研究了肿瘤内不同基因的表达,这些基因被打开或关闭。
研究人员专注于与 RAS 信号通路相关的基因,分析了包含这些基因在癌细胞中的活性信息的数据集。从这些数据集中并在 AI 的帮助下,他们编制了84个基因的独特基因特征。
当科学家们回顾性地查看来自 500 多名已经接受过治疗的肺癌患者的数据时,基因特征能够正确预测哪些患者会从化疗中受益,哪些不会从化疗中受益。
克里克癌症基因生物学实验室的共同主要作者和博士后研究科学家 Sophie de Carné 说:“由于提供了许多癌症疗法,并且有更多的药物正在试验中,因此预测哪种疗法最有可能发生癌症是一个挑战。由于我们知道 RAS 信号传导涉及各种耐药机制,我们希望我们的基因特征将有助于确定可以从特定治疗中受益的患者群体。
“与此同时,要实现这一目标还有很多工作要做。它需要在试验环境中进行测试,我们也在对其进行调整,以期使其更易于部署。”
克里克癌症基因生物学实验室的共同主要作者和主要小组负责人 Julian Downward 说:“我们的工作表明,RAS 信号通路是解释为什么肺癌患者对化疗有不同反应的关键因素。. 该通路中的基因表达水平比某些基因突变(包括 KRAS 基因突变)的存在更具决定性。”
克里克生物信息学和生物统计学平台的第一作者兼副负责人菲利普·伊斯特补充说:“由于先进的计算工具,我们可以利用大量现有的癌症数据。这项研究展示了这些数据集如何带来新的见解有可能改善患者的预后。”
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