哥廷根大学研究团队开发出完整基因数据的新方法

2022年1月4日整理发布：遗传信息的使用对于现代植物育种是必不可少的。尽管自 2003 年首次解码人类基因组以来，DNA 测序已经变得便宜得多，但收集完整的遗传信息仍然占动植物育种成本的很大一部分。降低这些成本的一个技巧是仅对基因组中非常小的随机选择部分进行测序，并使用数学和统计技术完成剩余的空白。哥廷根大学的一个跨学科研究团队为此开发了一种新的方法论方法，该方法已发表在PLoS Genetics杂志上。

“该方法的核心思想是识别‘单倍型块’，我们指的是基因组中由于遗传而在不同植物中非常相似的较长部分，并使用这种镶嵌结构来编译其余信息，”哥廷根大学综合育种研究中心的 Torsten Pook 博士说。“在繁殖种群中，使用这种新方法完成的序列质量堪比从 DNA 链中收集的信息量的 100 倍。”作为 MAZE 项目的一部分，研究人员的目标是培育不易受霜冻和干旱损害的玉米植物。该项目的合作伙伴 KWS Saat SE 已经在育种计划中使用该方法，因为它具有成本效益。

“另一个优点是，该方法不仅使我们能够检测 DNA 链中单个核苷酸的差异，而且还能识别迄今为止实际上无法用于育种目的的结构差异，”Pook 说。然而，就目前情况而言，该方法目前只能有效地用于植物育种中的自交系。一项后续研究已计划将该方法扩展到具有规则双组染色体的生物体。这意味着他们的新方法可用于大多数脊椎动物，包括人类。

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