对 SARS-CoV-2(导致 的病毒)以及人类和动物中的相关病毒的变种进行遗传和地理分析，可能会提供世界范围内种间传播的证据。生态健康联盟和孟加拉国流行病学、疾病控制与研究所的 Ariful Islam 博士及其同事于 2021 年 12 月 15 日在开放获取期刊 PLOS ONE 上介绍了这些发现。
先前的研究表明，SARS-CoV-2 可能起源于马蹄蝠中密切相关的病毒之间发生的基因变化。报告还表明，该病毒可以从人类传播到驯养和野生动物(称为溢出)。然而，关于 SARS-CoV-2 与世界各地动物相关病毒之间的流行病学、进化动力学和遗传关系，还有很多有待了解。
为了提供新的见解，Islam 博士及其同事对蝙蝠和穿山甲中发现的 SARS-CoV-2 相关病毒的基因组序列以及在各种世界各地的动物，包括狗、猫和狮子。
遗传分析表明，在动物中发现的 SARS-CoV-2 毒株与在同一地理区域(包括德国、法国、西班牙和丹麦)中发现的人类毒株密切相关，这证明了人与动物传播已在世界范围内发生的理论。将来，如果该病毒在动物宿主中建立，那么该动物物种可能会成为 SARS-CoV-2 的宿主。
研究人员还量化了在不同地区的动物物种中发现的与关键 SARS-CoV-2 亚型和变体相关的基因突变的程度。在许多国家的狗、大猩猩、狮子和猫等物种中发现了多个令人关注的新兴变异，例如 Alpha、Delta 和 Mu 变异，这些变异与人类 SARS-CoV-2 序列显示出显着的遗传相似性。例如，猫和美洲貂经常感染一种被称为 GR 进化枝的病毒亚型(分别占样本的 31.6% 和 49.7%)，这在人类中也很常见，支持了种间传播的可能性。然而，大多数狗都受到不同亚型 O 进化枝(66.7%)的影响，作者认为这表明进化枝 O 对狗具有特殊的亲和力。
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