病毒和其他致病微生物会影响宿主的免疫反应类型。在某些情况下，主要反应涉及抗体，即免疫系统产生的蛋白质，它可以特异性识别入侵微生物的部分并介导其破坏。在其他情况下，免疫细胞被训练识别微生物并触发对微生物的攻击。
科学家们广泛研究了导致抗体或细胞介导反应的机制。大约10年前，一种新的信号被提出作为细胞介导反应的触发因素。在目前的研究中，贝勒研究人员William Decker博士、Matthew Halpert博士、Vanaja Konduri博士及其同事提供了全面的证据来支持这一现象，并提出了其作用机制。
经典免疫反应
研究表明，与微生物相关的两个因素将显著影响占主导地位的免疫反应类型。一方面是微生物成分(蛋白质或遗传物质的一部分，称为病原体相关分子模式或PAMP)，另一方面是微生物的位置，无论它们倾向于位于细胞内部还是外部。细胞有办法识别PAMP吗？一些细胞蛋白质识别细胞内PAMP，而另一些检测细胞外PAMP。
对病毒的研究表明，当在细胞内检测到病毒遗传物质时，会发生细胞介导的免疫反应，而在细胞外检测到病毒蛋白则会引发抗体介导的反应。
这些免疫反应的实现涉及被称为模式识别受体或PRR的细胞蛋白质。抗原呈递细胞，如树突状细胞，参与形成特异性免疫反应的第一步。在这些最初的步骤中，抗原呈递细胞通过将PAMP与其PRR结合来对细胞内和细胞外环境进行采样。PRR识别PAMP将开启危险警报，并提醒免疫系统的其他部分警惕外来入侵者。
触发细胞介导免疫反应的新机制
除了这些研究的介导经典免疫反应的信号，贝勒研究人员还提出并证明了一种不同的机制来指导针对细胞类型的免疫反应。这种新的机制还包括监测细胞内和细胞外的环境，但它需要由另一种叫做MHC的蛋白质来监测。第一类MHC结合细胞中发现的蛋白质片段，而第二类MHC结合细胞外发现的蛋白质片段。
该著作的对应作者病理与免疫学副教授Dacker说：“这种机制似乎主要发生在暴发性病毒感染发生时。”
当病毒大量繁殖时，在细胞内外都能发现大量的病毒蛋白。这种情况的一个可能结果是，相同的蛋白质片段与抗原呈递细胞上的MHC类和类蛋白质结合。
达克(Bayker的Dan L Duncan综合癌症中心成员)说，当这种情况与其他炎症线索一起发生时，“它会引发一种反应，从而增强细胞介导的对病毒的免疫力。”“在这种情况下，反应不依赖于任何特定的PAMP结构。这取决于MHC类和MHC类结合的病毒片段具有相同的氨基酸序列。”
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