最大的植物基因组测序工作产生了鹰嘴豆的泛基因组

来自 41 个组织的国际研究人员团队通过对来自 60 个国家/地区的 3,366 个鹰嘴豆品系的基因组进行测序，组装了鹰嘴豆的泛基因组。在国际半干旱热带作物研究所 (ICRISAT) 的领导下，该团队确定了 29,870 个基因，其中包括 1,582 个以前未报告的新基因。这项研究是同类植物中最大的一项研究，将鹰嘴豆放入具有如此广泛基因组图谱的一小群作物中。

“通过采用全基因组测序，我们已经能够确认鹰嘴豆在新月沃地的起源历史，并确定鹰嘴豆向世界其他地方扩散或迁移的两条路径。一条路径表明向南亚和东非扩散，另一条表明向地中海地区(可能通过土耳其)以及黑海和中亚(直至阿富汗)扩散，”研究机构 Rajeev Varshney 教授说。 ICRISAT 的项目主任和该研究的负责人，该研究于 11 月 10 日发表在《自然》杂志上。

他补充说：“更重要的是，这项研究提供了鹰嘴豆遗传变异的完整图景，以及利用知识和基因组资源改进作物的经过验证的路线图。”

鹰嘴豆在 50 多个国家种植，是世界第三大种植豆类。它对许多国家的饮食必不可少，也是膳食蛋白质的重要​​来源，尤其是在全球南方。ICRISAT于 2013 年率先对第一个鹰嘴豆基因组(喀布尔品系)进行了测序。该序列为开发用于作物改良的分子资源铺平了道路。

不久之后，随着对包括地方品种和野生类型在内的物种水平的遗传变异的完全了解的需求变得明显，对更多品系进行测序的更大努力开始了。在最新的研究中，该研究的作者报告对多个基因库中保存的鹰嘴豆的 3,171 个栽培种质和 195 个野生种质进行了测序。这 3,366 个种质代表了鹰嘴豆在更大的全球收藏中的遗传多样性。

栽培的鹰嘴豆在科学上被称为Cicer arietinum。该研究指出，大约 12,600 年前，C. arietinum与其野生祖先Cicer reticulatum 不同。鹰嘴豆的历史与大约 10,000 年前开始的强大的遗传瓶颈有关。人口规模在大约 1000 年前达到最低点，然后在过去 400 年出现强劲增长，这表明全球对鹰嘴豆农业重新产生兴趣。作者在研究中报告说，用于分析 8 个Cicer物种随时间变化的方法也可用于识别种质的错误分类或重复，以更好地管理基因库中的种质。

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