病毒测序可以揭示SARSCoV2如何传播和进化

埃默里大学生物学副教授卡蒂亚科勒(Katia Koelle)表示，新型病毒变种的出现增加了对抗新冠的波折，表明需要对该病毒进行更好的基因组监测。

科尔说：“新型基因组跨州监测的改进将真正帮助我们更好地了解大流行病毒在美国的发展和传播。”“需要更多的联邦资金和集中的样本收集和基因测序标准。研究人员需要访问这样的元数据，以便更好地跟踪病毒的地理传播，并识别任何可能难以控制的新变种，以便卫生官员能够更快、更有效地做出反应。”

Koelle研究了病毒进化和病毒传染病流行病学传播之间的相互作用。她是刚刚发表在《观点》杂志上的文章《科学》的资深作者，这篇文章讲述了对新型-2进行测序以控制新冠大流行的重要性。

迈克尔马丁是埃默里大学人口、生物学和生态规划专业的博士生，科勒实验室成员，《科学》杂志第一作者。大卫凡尼斯伯格是科勒实验室的博士后研究员，也是这本书的合著者。

马丁说：“对新型的研究一直在以闪电般的速度进行。”“这种加速为我们提供了迄今为止最快的疾病数据集之一。到目前为止，我们已经了解了很多关于这种病毒如何传播和适应的知识，但我们仍有许多盲点需要解决。”

本文总结了对新型的关键见解，这些见解是通过对每个患者样本的基因组测序获得的。它还列出了剩余的挑战，包括收集元数据并将其整合到遗传分析中，以及需要为成千上万个基因组开发更有效和可扩展的计算方法。

基因组是生物体的遗传物质。人类基因组由双链DNA组成，由四个不同的核苷酸碱基字母编码。人类基因组由30多亿个碱基对组成。相反，包括新型在内的的基因组是由核糖核酸组成的，其结构比脱氧核糖核酸简单。例如，新型基因组由一个只有30，000个字母长的核糖核酸链组成。排序是一种能读懂这些字母的技术。

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