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对海水中潜在益生菌的快速测试可能会揭示珊瑚的健康状况

多机构研究团队开发了一种方法,可以快速、无创地测试已知有益于珊瑚的细菌种类——他们测试珊瑚附近的海水。他们的方法于 7 月 18 日首次在线发表在《海洋生物技术》上,并登上了该杂志8 月印刷版的封面。

“一些珊瑚相关细菌被认为是保护珊瑚的益生菌,为了开发珊瑚益生菌,收集这些细菌进行进一步研究很重要,”论文作者、生命与环境研究生院助理教授 Natsuko Miura 说。大阪府立大学理学部。

她还指出,检测和识别细菌是检查珊瑚菌群平衡的关键,即任何生物体上存在的细菌的集体平衡。

“此前,研究人员建议,珊瑚周围海水中微生物菌群的组成可以用作环境指标,”三浦说,并解释说,挑战在于确定海水中细菌的分布究竟如何反映珊瑚的健康状况。“为了更好地理解这一点,我们从珊瑚中收集和分析细菌。但是,在以前的收集方法中,珊瑚相关细菌是通过破坏珊瑚体获得的。我们认为为了保护珊瑚而破坏珊瑚是有问题的。”

研究人员着手开发一种快速检测方法,以识别从珊瑚礁周围采集的海水样本中的有益细菌。他们专注于Galaxea fascicularis,这是一种在冲绳濑底岛海岸发现的造礁珊瑚。物种Ruegeria细菌被认为提供这种珊瑚益生菌的好处,如维生素B12生产和防范一些病原体,根据三浦。

通常,为了识别特定物种,研究人员使用称为引物的两个定义的遗传密码片段来靶向和分离所需的更长的遗传序列。一旦分离,该序列可以被复制和扩增足够大的数量以匹配单个物种。通常,潜在的引物是根据各种遗传因素提出的,但需要验证。

除了新开发的引物外,Miura 和她的团队还假设,2020 年提出的 55 种引物中的两种引物的物理特性是验证此开发期间海水含量所需的,可以可靠地识别海水样本中的Ruegeria物种,并几个小时内从濑底岛周围的珊瑚。他们是对的。

“我们的结果表明,这种特定的引物组可以轻松快速地分离特定细菌种类,促进感兴趣细菌的分离,”Miura 说,并补充说,他们发现珊瑚中Ruegeria种类的浓度高于海水中的浓度,这表明细菌可能集中在珊瑚中。“虽然需要进一步的研究来确定珊瑚和海水中细菌丰度的差异,但新开发的方法可以更容易地快速检查珊瑚周围的海水是否在不破坏珊瑚的情况下获得了有益的珊瑚相关细菌。”

Miura 表示,研究人员现在正在向公共存储库提供已鉴定细菌物种的样本,希望其他人能够扩大和加速这项工作,以更好地了解和使用珊瑚益生菌。

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