研究人员发现可以使用新的计算机程序自动计算作为癌细胞标志物的微核
筑波——微核是细胞内的小核样结构,通常与肿瘤有关。现在,来自筑波的研究人员开发了一种自动计算机程序,可以准确、可重复地从显微镜图像中计算这些结构,这将提高微核研究的速度和准确性。
在最近发表的研究中,来自筑波大学的研究人员报告了他们的新的基于MATLAB程序,命名为协会专栏(çalculating一个utomatic中号icronuclei迪stinction),它会自动从染色细胞的图像中计算微核。微核的染色方式与常规细胞核相同,但它们与细胞核的区别在于它们的尺寸要小得多。然而,识别它们说起来容易做起来难,因为用于计数微核的自动系统传统上只使用从单层组织获取的图像。要理解为什么这很重要,请想象通过固定在空间中的球切割横截面。如果您在靠近球的顶部或底部区域切下一个切片,则横截面的尺寸将比您选择一个靠近中心的切片小得多——因此,一个靠近核外围的横截面很容易被误认为是微核。
为了解决这个问题,筑波大学的研究人员通过细胞或组织拍摄了不同层次的照片,并创建了一个能够分析由此产生的三维信息的程序。通过这种方式,他们确保程序计算为微核的实际上是微核。然后他们使用该程序观察小鼠神经元中的微核,并测试了神经炎症对微核数量的影响。
“据报道,炎症与癌细胞微核之间存在联系,”该研究的通讯作者 Fuminori Tsuruta 博士说。“我们决定测试大脑中的神经炎症是否会影响神经元中微核的数量。”
为此,研究人员首先将炎症因子引入培养生长的小鼠神经元中,但他们使用 CAMDi 程序发现微核数没有变化。然而,当他们给小鼠注射脂多糖时,海马区的炎症细胞被激活,海马神经元中的微核增加了。
“这些结果令人惊讶,”鹤田博士解释说。“他们表明,神经元中微核的形成是由附近细胞的炎症反应诱导的。”
鉴于微核是一系列病理的标志物,这种新计算机程序的开发对于病理诊断和治疗反应的跟踪可能非常重要。使用 CAMDi 也将加强对微核的研究,以更好地了解它们的形成和在疾病中的作用。
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