研究人员揭示了分枝杆菌基因组中控制压力适应的隐藏特征

由遗传学系助理教授刘青云博士领导的一项新研究发现了一种被称为“转录可塑性”的遗传特征，它在控制分枝杆菌对应激条件的转录反应中发挥着关键作用。

细菌细胞必须迅速调节其基因的表达，以应对外部环境的突然变化。然而，某些基因在多大程度上可以响应环境变化而改变其表达，而不是维持稳定的表达水平，长期以来一直困扰着科学家。了解细菌如何调节这些不同的转录过程及其背后的遗传特征仍然是一个挑战。

首席研究员刘清云博士与北卡罗来纳大学教堂山分校、哈佛大学和复旦大学的研究人员合作，着手解开结核分枝杆菌 (Mtb) 转录反应的复杂因素，结核分枝杆菌是导致结核病的细菌病原体。结核病仍然是单一传染源导致死亡的主要原因，每年有超过 1060 万新病例和 160 万人死亡。

他们的研究题为“结核分枝杆菌应激适应的基因编码转录可塑性”，发表在《自然通讯》杂志上。

研究人员分析了一个综合数据集，其中包含来自 73 个不同条件的 894 个 RNA-Seq 样本，这些样本是在之前的研究中生成的，并由研究人员出于荟萃分析的目的而整理。

研究人员研究了结核分枝杆菌每个基因的转录可塑性(TP)，作为基因表达响应环境变化的变异性的代表。他们的分析揭示了 Mtb 基因之间显着的 TP 变异，与基因功能和必要性相关。此外，他们发现关键的遗传特征，如基因长度、GC 含量和操纵子大小，独立地对 TP 施加限制，超出了反式调节的范围。

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