追踪细胞谱系的新工具

洛桑联邦理工学院的研究人员开发了 GEMLI，这是一种开创性的工具，可以使我们研究细胞从胚胎状态到在体内发挥特殊作用的过程，以及它们在癌症和其他疾病中的变化的研究方式民主化并极大地改善。《自然通讯》报道了这一进展。

在错综复杂的生命之舞中，细胞繁殖和多样化形成生物体的不同部分，了解每个细胞的起源至关重要。这就是生物学家所说的“细胞谱系”——细胞的家谱。正如您可以追溯到祖父母或更远的祖先一样，科学家可以追踪细胞如何分裂并从单个“亲代”细胞进化为各种“子代”细胞，每个子代细胞在体内都有自己的作用。

追踪细胞谱系有助于我们了解复杂的生物体(如人类)如何从单个受精卵发育成具有数万亿个特化细胞的生物，以及这个过程的破坏如何导致癌症等疾病。然而，该领域面临着一些重大障碍，主要是因为谱系追踪需要复杂且劳动密集型的技术。

杰姆利简介

现在，由 EPFL 的 Almut Eisele 和 David Suter 领导的科学家开发了一种计算工具，可以计算出细胞之间的谱系关系，而不需要专门的实验谱系追踪方法。

该工具名为基于基因表达记忆的谱系推断 (GEMLI)，仅需要单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据，这是一种广泛使用的技术，可捕获单个细胞在任何时间表达的基因的“快照”。给定时间。

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