单细胞 RNA 测序分析揭示五种自身免疫性疾病的免疫细胞异质性

自身免疫性疾病是由于免疫异常攻击健康细胞、组织或器官而引起的一组疾病。单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术提供单细胞分辨率的转录组信息，从而为研究自身免疫性疾病提供了一种新方法。然而，大多数单细胞 RNA 测序研究通常集中于一种类型的自身免疫性疾病。

这项研究发表在BIO Integration上，整合了五种不同自身免疫性疾病(IgA 肾病 [IgAN]、川崎病 [KD]、多发性硬化症 [MS]、干燥综合征 [SS] 和系统性红斑狼疮[SLE])。对这些数据中的所有免疫细胞进行了维度聚类、细胞通讯分析、单核细胞、NK 细胞群的重新聚类分析、差异基因表达分析和功能富集。

整合了五种不同自身免疫性疾病(IgAN、KD、MS、SS 和 SLE)外周血细胞的 scRNA-seq 结果。尽管五种疾病的细胞簇群不同，但所有样本均包含 18 种不同的免疫细胞亚群。

通过细胞间通讯网络分析，研究人员确定 IgAN 和 SLE 患者的经典和非经典单核细胞信号显着增强。KD 患者的初始 B 细胞信号增强。有趣的是，NK 和 NK-T 细胞的信号在 SS 患者中增强，但在 IgAN 和 SLE 患者中减弱。

对经典和非经典单核细胞亚群的转录组分析进一步揭示，促炎细胞因子和干扰素相关基因，包括 CCL3、IL1B、ISG15 和 IFI6，在 IgAN 和 SLE 患者中特异性增加。与单核细胞不同，IgAN 和 KD 患者的数量和 NK 标记基因减少，但 SS 患者的数量和 NK 标记基因增加。同时，在 SS 中专门发现了两种 NK-T 细胞亚群。

综上所述，基于单细胞RNA-seq结果的整合，该团队证明了五种不同自身免疫性疾病的免疫细胞景观在免疫细胞亚群、群体、差异表达基因以及细胞与细胞之间的关系等方面的变化。 -蜂窝通信网络。这些数据为进一步探索不同自身免疫性疾病之间的异质性和相似性提供了新的见解。

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