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寻找癌症基因的共享网络
威尔莫特癌症研究所的研究人员离了解导致细胞恶性的复杂基因相互作用又近了一步。在今天发表的一项新的Cell Reports研究中,该小组使用网络建模来研究一组对恶性肿瘤至关重要的相互作用,并且可能成为广泛癌症治疗的沃土。
可以被药物靶向的离散基因突变仅在一小部分癌症类型中被发现。但是这些突变依赖于非突变基因的下游网络才能导致癌症。这些下游基因及其错综复杂的相互作用可能在许多癌症中很常见,并且可以为癌症治疗带来巨大的飞跃。
该研究的主要作者之一,Hartmut “Hucky” Land 博士,他是威尔莫特癌症研究所副所长,罗切斯特大学医学中心生物医学遗传学罗伯特和多萝西马克教授,并曾在确定癌症的共同核心特征超过 10 年。他的目标是找到癌症的共同弱点并加以利用。
“靶向使细胞癌变必不可少的非突变蛋白质是一种更广泛的方法,可用于多种癌症,”兰德说,“但很难找到这些非突变的必需基因。”
这就是 Land 求助于威尔莫特癌症研究所研究员、URMC 生物统计学和计算生物学副教授 Matthew McCall 博士、MHS 的原因。该研究的另一位主要作者麦考尔开发了一种新的网络建模方法,称为 TopNet,该小组将其与细胞和小鼠的基因实验配对,以确定功能相关的基因网络。
兰德的小组之前确定了一组非常多样化的非突变基因,这些基因对癌症至关重要。在这项研究中,该小组想看看这些基因是如何相互作用的——从 20 个基因的子集开始。在培养的细胞中增加或减少一种基因的表达会对组中其他基因的表达水平产生多种影响。
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