阿拉巴马州伯明翰——肠道中的微生物混合物可以塑造一个人的免疫反应。例如，在黑色素瘤的免疫治疗中，肠道微生物群的组成与抗 PD-1 治疗在动物模型和癌症患者中的疗效相关。
今年发表在《科学》杂志上的一项临床试验将成功接受抗 PD-1 黑色素瘤治疗的患者的粪便移植到对抗 PD-1 治疗耐药的黑色素瘤患者的结肠中;然后接受者接受抗PD-1治疗。研究人员在接受者体内发现了一种快速而持久的微生物群扰动，15 名患者中有 6 名受益于复合疗法。研究人员得出结论，粪便微生物移植能够克服对抗PD-1疗法的抵抗。
在研究人员阿拉巴马大学伯明翰大学医学院马尼克斯E. Heersink学校现在已经使用了粪便宏基因组测序数据集从该研究-以及来自其他两项研究的DNA测序数据集-看到具体的供体菌株是否建立了自己在受体患者中以及这些供体菌株是否与成功的治疗结果相关。
研究人员 Hyunmin Koo 博士和 Casey Morrow 博士能够使用 UAB 开发的微生物组“指纹”方法识别细菌物种的特定单一菌株。该方法使用强大的基因组工具和超级计算机来分析来自粪便样本宏基因组测序的大量遗传数据。
这种新的生物信息学技术此前已经表明，除其他研究外，在肥胖手术和抑制性抗生素后出现了新的微生物菌株，以及在粪便微生物移植治疗复发性艰难梭菌后，供体微生物菌株稳定存在长达两年之久。感染。
现在，在BMC Microbiology 上发表的一项研究中，Koo 和 Morrow 报告说，就粪便微生物移植后受体患者的粪便占优势的供体微生物而言，黑色素瘤患者的个体差异与对抗 PD-1 的反应无关治疗。
详细地，他们分析了 Baruch 等人发表的宏基因组测序数据集。在 2021 年的《科学》杂志上，他发现粪便微生物群移植后受者患者粪便中共生供体微生物的存在与患者对免疫疗法的反应无关。
他们还分析了 Davar 等人发表的宏基因组测序。2021 年获得科学博士学位。“来自 Davar 等人。数据集中，我们发现四名对免疫疗法有反应的患者在粪便微生物移植后有供体相关菌株，而对免疫疗法没有反应的两名患者在粪便微生物移植后也有供体菌株，”莫罗说。“重要的是，我们在一名对免疫疗法有反应的粪便微生物移植后接受者的粪便中没有发现供体微生物。”
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