多位点多组学分析揭示了终末期卵巢癌的多种耐药机制

由澳大利亚墨尔本 MacCallum 癌症中心的研究人员领导的国际团队检查了从 15 名晚期高级别浆液性卵巢癌 (HGSC) 患者采集的约 270 个多部位尸检样本中的 391 个肿瘤组织。所有提供的尸检样本都来自最初对癌症治疗有反应但在复发时对这些疗法产生抗药性的患者。

该分析在不同程度上对收集的样本使用了全基因组测序、靶向基因测序、RNA-seq、蛋白质组学、甲基化和多色免疫荧光。研究人员寻找转移部位内部和之间的变异，重点关注个体患者体内发生的耐药机制的数量，并发现了从不同克隆细胞和亚克隆突变的数量到耐药机制分布的高度变异性。

所有患者都被发现患有多克隆疾病，平均有 5 个克隆，从 2 个到 9 个不等。虽然癌症可能从单克隆开始，但一个坏细胞会复制自身的克隆，拥有许多(多)克隆可能意味着癌症来自不同细胞的多个起点。不同的起点会使评估有效的治疗路径变得更加困难，因为分化的克隆可能会产生不同的治疗抗性。相比之下，单个克隆的存在将意味着可能能够识别和克服的高效、单一的抗性机制的进化。

来自患者体内空间不同位点的耐药性相关基因的靶向测序显示很少有共享突变，研究人员检测到的耐药性机制很少存在于个体的所有样本中。他们观察了通常是亚克隆的趋同耐药性和耐药机制的例子。广泛的基因组变异性在克隆和拷贝数异常中很明显，它们删除或放大了大的连续代码段。

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