研究人员开发了一种用于分析多路复用组织成像数据的新软件

由伦敦国王学院癌症与药物科学学院和免疫学与微生物科学学院以及弗朗西斯克里克研究所癌症系统生物学实验室的一组研究人员在 Francesca Ciccarelli 教授的带领下发表了新论文，展示了用于分析复杂药物的新型软件组织成像数据。

最近开发的多路复用成像技术，例如成像质谱流式细胞仪 (IMC)，能够详细研究组织细胞组成，这对于绘制疾病的组织水平特征和预测依赖于组织环境的治疗结果具有特殊价值，例如癌症免疫治疗。这些技术通常会产生大量难以分析的高维数据，并且通常需要多种工具和具有计算专业知识的用户。

SIMPLI(来自多重图像的单细胞识别)是一种灵活的软件，它统一了多重成像数据分析的所有步骤，也为非专业人士提供了高维成像数据分析的改进替代方案。SIMPLI 对每个组织载玻片进行空间分辨的单细胞分析，并对标记表达进行与细胞无关的量化，以研究在细胞水平上无法检测到的特征。它还生成表格和图形输出，便于在分析的每个步骤中对结果进行目视检查。

“几年前我们开始使用高维 IMC 数据时，用于分析的工具并不多。多亏了博士 Michele Bortolomeazzi 的才华，开发我们自己的工具非常有趣. 由 CRUK KHP 中心资助的学生，并利用 Jo Spencer 教授在组织组织学方面的丰富专业知识，”Francesca Ciccarelli 教授说。

为了测试 SIMPLI 的性能和多功能性，研究人员分析了使用不同成像技术(包括但不限于 IMC)获得的图像，这些图像的来源、大小和分辨率各不相同。

伦敦国王学院是欧洲首批拥有 Helios 成像质谱流式细胞仪的机构之一，可在 BRC 流式细胞仪平台上使用。

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