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eDNA 测序将使科学家能够在不捕鱼的情况下探索亚马逊地区的鱼类多样性

导读 在巴西、哥伦比亚和秘鲁边界的 Javari 河流域进行的一次科学考察表明,使用环境 DNA 测序来调查亚马逊地区的鱼类多样性是可行的。eDNA

在巴西、哥伦比亚和秘鲁边界的 Javari 河流域进行的一次科学考察表明,使用环境 DNA 测序来调查亚马逊地区的鱼类多样性是可行的。eDNA 方法包括提取水样中存在的 DNA 分子并通过遗传标记识别它们所属的物种。

发表在《科学报告》杂志上的一篇关于这项研究的文章还讨论了该技术在研究亚马逊河这样高度多样化的环境方面的局限性。

“我们需要继续通过传统方法捕捉和识别动物,以创建遗传材料库。它们将作为比较水样中发现的任何物质的参考。美国史密森学会国家自然历史博物馆的研究助理卡洛斯·大卫·德桑塔纳说,随着技术的进步,几年后我们可能无需捕捉就能了解一个地方存在的所有鱼类。州和文章的第一作者。

这项研究是该项目的一部分,“多样性和电鳗目的进化”,由FAPESP支持和领导Naércio梅内塞斯在圣保罗动物博物馆(MZ-USP)在巴西的大学教授。“从水样中提取 DNA 产生了非常有利于保护环境的期望,因为收集水生动物样本的常用方法包括使用网和其他具有负面影响的渔具,”梅内塞斯说, ——文章作者。

这组研究人员在 Javari 河上度过了 18 天,在他们收集鱼类标本的 46 个地点中的三个地点收集水样。所代表的物种数量达到了惊人的 443 个,其中 60 个是科学上的新物种。

在收集用于 eDNA 分析的水的地点,使用传统方法捕获了 201 个物种。然而,只有 58 个,即总数的 26%,通过 eDNA 分析在物种水平上得到了精确鉴定。

“一个可能的解释是数据库中缺乏可用于比较的参考遗传材料。此外,这些地方的许多物种都是全新的,在使用传统技术之前从未被发现,”圣保罗联邦大学海洋科学研究所 (IMAR-UNIFESP) 教授Gislene Torrente-Vilara 说,文章的共同作者。

Torrente-Vilara 作为亚马逊鱼类项目的一部分领导了这次探险,这是一项由 FAPESP 支持的国际合作,导致对该地区鱼类分布的新认识(更多信息见:agencia.fapesp.br/31956)。

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