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中子显示丙肝抗病毒药物新型之间不可预测的结合

导读 科学家发现,当新型病毒(导致新冠的病毒)遇到被称为抑制剂的药物时,会出现新的意想不到的行为。这些药物与病毒的某些成分结合,阻断其复制

科学家发现,当新型病毒(导致新冠的病毒)遇到被称为抑制剂的药物时,会出现新的意想不到的行为。这些药物与病毒的某些成分结合,阻断其复制能力。

该研究发表于《药物化学杂志》,为促进新冠的药物设计和药物再利用提供了重要见解。

能源部橡树岭国家实验室的研究人员利用中子散射研究了治疗丙型肝炎病毒感染的药物特拉普韦和负责病毒繁殖的酶新型蛋白酶之间的相互作用。

他们在蛋白酶的药物结合位点发现了不可预测的电荷变化,这是计算机模拟无法预测的。

第一作者丹尼尔科内尔说:“我们发现了这种特殊的蛋白质——新型主要蛋白酶——许多研究人员正在通过计算方法研究它,这显示了令人惊讶的方式。”“我们的发现为改进计算机建模提供了重要的实验数据,从而使模拟更加符合实际情况。”

病毒通过组装一条由近2000个氨基酸组成的蛋白质或多肽长链进行传播,必须被主要蛋白酶切割成更小的链。寻找能有效阻断或抑制蛋白酶功能的药物,以防止病毒复制并传播到体内其他健康细胞,这一点非常重要。

在之前的研究中,研究团队使用中子和X射线散射来构建新型蛋白酶中每个原子的完整图谱。他们确定了药物抑制剂和蛋白酶的结合位点,并绘制了将蛋白酶结合在一起的氢键网络。他们还确定了发生多蛋白切割的蛋白酶氨基酸位点的正电荷、负电荷和中性电荷的位置。

“在这项研究中,我们发现当Dantras Pravir与主要蛋白酶结合时,结合位点的质子化状态发生了变化(质子增加或减少),这意味着氢原子的位置发生了变化;本质上,一些氨基酸位点增加或减少了氢原子,从而改变了它们的电荷。”ORNL记者安德烈科瓦列夫斯基说。

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