Aging-US:肝细胞癌的枢纽候选网络
Aging-US发表了“与环状 RNA 相互作用的 RNA 结合蛋白和肝细胞癌枢纽候选网络的鉴定”,其中报告了来自临床蛋白质组学肿瘤分析联盟、癌症基因组图谱和国际癌症基因组的 17 种 DERBP,在 HCC 中通常失调联盟项目被用来构建 RBP-circRNA 网络。
此外,基因集富集分析表明,失调的 TARDBP 可能参与了一些与 HCC 发病机制相关的通路。
因此,基于 TARDBP 生成了一个集线器 RBP-circRNA 网络。
RNA 免疫沉淀和 RNA 下拉证实 hsa_circ_0004913 与 TARDBP 结合。
这些研究结果发表在Aging-US 上,表明某种 RBP-circRNA 调控网络可能参与 HCC 的发病机制,这为 HCC 的研究机制和生物标志物鉴定提供了新的见解。
南方医科大学陈玉涵博士说:“肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝癌类型。”
先前的研究表明,circRNAs可以作为RNA结合蛋白的海绵,同时RBPs也能够参与反向剪接。因此,与 RBPs 的相互作用也可以被视为探索 circRNAs 功能的关键因素。
然而,关于 RBP-circRNA 相互作用对 HCC 的影响的研究很少,需要更多的探索。
在这项研究中,作者从基因表达综合数据库中筛选出 HCC 病例中差异表达的 circRNA,并预测了与 DEcircRNA 结合的 RBP。
在评估来自临床蛋白质组学肿瘤分析联盟、国际癌症基因组联盟和癌症基因组图谱项目的 HCC 中 RBPs 的表达水平后,他们利用 17 个常见的 DERBPs 构建了 HCC 中的 RBP-circRNA 调控网络。
这些发现表明某些RBP-circRNA网络可能与HCC密切相关,为HCC的研究机制提供了思路。
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