Sci-space可以帮助构建哺乳动物胚胎发育图谱

一种称为 sci-Space 的新技术与来自其他技术的数据相结合，可以在哺乳动物胚胎发育过程中生成跨不同细胞的基因表达的四维图谱。

这样的图谱将绘制单个细胞中的基因转录如何反映时间的流逝、细胞谱系、细胞迁移和发育中胚胎的位置。它们还将有助于阐明基因表达的空间调节。

哺乳动物胚胎发育是一个非凡的现象：受精卵反复分裂并在几周或几个月内变成一个复杂的有机体，能够进行无数的生理过程并由各种细胞、组织、器官、解剖结构组成。

更好地了解哺乳动物在出生前是如何形成的——尤其是胚胎发育过程中单细胞水平基因表达的产前空间模式——可以促进对各种条件的生物医学和兽医研究。这些范围从遗传性疾病到先天性畸形和发育迟缓。了解器官的起源也可能有助于未来的再生医学工作。

由 UW Medicine、Howard Hughes 医学研究所和西雅图 Brotman Baty 精密医学研究所的科学家领导的国际团队展示了他们在小鼠胚胎中的 sci-Space 技术的概念验证。

他们的结果发表在 7 月 2 日的《科学》杂志上。主要作者是华盛顿大学医学院基因组科学系的 Sanjay R. Srivatsan 和华盛顿大学生物工程系的 Mary C. Regier。

资深作者是华盛顿大学医学基因组科学教授、布罗特曼巴蒂研究所所长杰伊·申杜尔，以及艾伦细胞谱系追踪发现中心的研究员;华盛顿大学生物工程助理教授 Kelly R. Stevens;和基因组科学副教授 Cole Trapnell。Regier 和 Stevens 还是 UW 医学研究所干细胞和再生医学研究所的研究员。

研究人员观察了 120,000 个细胞核中基因的编排。身体的所有体细胞都包含相同的 DNA 代码。当小鼠胚胎成形时，研究人员捕获了有关这些细胞核中哪些基因被打开或关闭的信息。科学家们还研究了胚胎中细胞的位置如何影响发育过程中哪些基因被激活。

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