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自身免疫性疾病的首例地图集复杂性

的研究人员已经建立了关于自身免疫和自身炎症性疾病的首个基因数据库。该资源将使专家能够更深入地了解免疫疾病如何发展并计划未来的药物开发项目。科学家们还希望,这种与免疫相关的基因组数据图集最终可以应用于诸如之类的传染病调查。

“要了解疾病,必须深刻理解遗传变异的功能。借助该数据集,我们可以将与疾病相关的DNA序列变化的数据与对疾病发病重要的基因和细胞类型联系起来。”东京大学项目研究副研究员Mineto Ota,医学博士,临床风湿病学家和功能基因组学专家。大田(Ota)是最近发表在《 Cell》杂志上的这项研究的主要作者。该项目由RIKEN研究机构和Chugai Pharmaceutical Co.,Ltd.的合作者完成。

许多先前的研究项目已将具有医学诊断结果的患者的全基因组序列与健康人的基因组序列进行了比较。然后将在这些全基因组关联研究中鉴定出的任何DNA序列变异体视为“关联”

在关联研究中发现的许多变体并不位于基因,即遗传的基本单位,而是位于调节基因“开启”或“关闭”表达的DNA部分。人类基因组的大部分不是基因,而是这种调节性DNA。专家可能知道DNA的一部分与基因调控有关,但并不确切了解其方式或作用,甚至调控的基因。

为了揭示调节性DNA的功能,另一种类型的基因组研究称为表达定量性状基因座(eQTL)分析,试图将DNA序列的差异与基因表达的差异联系起来。利用eQTL数据,研究人员可以对调节DNA序列的目的,调节序列中的变体如何影响其调节基因的表达以及这些基因表达的差异如何导致疾病做出更明智的猜测。

还进行了其他针对免疫的eQTL研究,但先前的研究工作仅包括健康志愿者,并检查了有限数量的细胞类型。

“与健康状况下的相同细胞相比,炎性疾病在免疫细胞中产生的生理特征非常不同。与免疫状况相关的遗传变异可能仅在患病状态下起作用,因此对于这种类型的基因研究,获得重要的信息是非常重要的。来自真实患者的样本。”大田说。

该研究小组对79名健康志愿者和337名被诊断患有10种不同类型的免疫介导疾病(包括类风湿性关节炎,系统性红斑狼疮和系统性硬化症)的患者的患者的全基因组进行了测序。所有志愿者都有血统。

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