Omicron遗传学和早期传播模式的特征

根据一项研究，由于适应性进化，SARS-CoV-2 的 omicron 变体与以前的 SARS-CoV-2 变体不同，其中有益的突变通过自然选择而不是通过以前变体之间的重组传递给后代。庞大的国际研究团队。该研究最近发表在《自然》杂志上，首次描述了 omicron 的基因组谱并探索了该变体的起源。

生物学副教授 Maciej Boni 说：“我们已经看到 SARS-CoV-2 在大约 16 个月内产生了三种主要变体——alpha、delta 和omicron，这非常令人惊讶，因为其他病毒不会进行如此重复的大进化飞跃。” ，宾夕法尼亚州立大学，他领导了这项全球合作的重组分析。“最新的变种——omicron——之所以非同寻常，是因为它在其刺突蛋白的进化过程中实现了更大的飞跃。”

Boni 指出，与以前的变体相比，omicron 的刺突蛋白有 30 多个突变，其中许多已知会影响宿主抗体的中和。

“鉴于 omicron 在进化上取得了如此大的飞跃，我们想调查这可能发生的原因和方式，”他说。

为此，由南非流行病应对与创新中心领导的团队分析了截至 2021 年 12 月 7 日可用的所有 686 个 omicron 序列。他们发现 omicron 属于 B.1.1 谱系，其中还包括 alpha 变体。有趣的是，该团队发现 omicron 在基因上不同于 alpha，以及任何其他已知的感兴趣的变体。

“这意味着，尽管 omicron 与 alpha 变体属于同一血统，但它已经发生了很大的变化，以至于它在很大程度上无法识别为 alpha 变体的表亲或侄子，”Boni 说。“当首次对 omicron 基因组进行测序时，很明显这种病毒有可能在表型上与我们熟悉的以前的 SARS-CoV-2 变体非常不同。”

为了确定 omicron 变体何时首次出现，该团队使用了一种称为时间校准贝叶斯系统发育分析的技术。他们估计，所有 omicron 的最近共同祖先存在的日期是 2021 年 10 月上旬。

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