超级计算机加入了对抗抗生素耐药性的斗争
参与的研究人员在波鸿鲁尔大学(RUB)、德国杜伊斯堡-埃森大学(UDE)、英国朴茨茅斯大学以及澳大利亚昆士兰大学和以色列魏茨曼研究所工作。
新抗生素研发困难重重
开发一种新的抗生素特别困难,而且自 1960 年代以来,几乎没有开发出新的抗生素类别。在目前的研究中,研究人员采用了另一种方法。他们没有开发一种全新的类型,而是从已经存在的抗生素开始,然后对其进行修改。为此,他们使用了一种策略,通过计算模拟候选人的几个方面。除其他外,抗生素的溶解度、穿透细菌膜的效率以及阻断病原体蛋白质产生的效率对其有效性都很重要。“在实际合成之前对化合物是否具有活性进行计算评估避免了化学浪费。”RUB 的 RESOLV 教授 Frank Schulz 解释道。
头对头
过去表明,对新抗生素产生抗药性的时间通常不会太久。因此,预计细菌将针对研究人员的对策制定对策,并对新的抗生素变体产生抗药性。“我们希望通过这项研究表明,可以通过计算策略以系统的方式解决细菌的耐药机制,从而帮助更快、更经济地开发新的抗生素衍生物”,该研究所负责人 Elsa Sanchez-Garcia 教授解释说。 UDE 的计算生物化学组和 RESOLV 的首席研究员。“通过这种方式,科学可以不断地反击新抗生素的计算机辅助开发。”
有前途的候选人
对超级计算机计算的结果进行了实验测试。在研究中,研究团队不仅实施了基于计算机的模拟方法,还提出了一种新的有前景的候选药物。与世界卫生组织基本药物清单上的两种已知抗生素相比,该候选药物仍必须进行临床测试,其对测试细菌菌株的活性高达 56 倍。新的抗生素变体不仅对测试的目标生物更有效,而且对世界卫生组织优先列表中排名最高的三种细菌也显示出活性,而现有测试的抗生素对其无效。除了这一成功之外,还创建了一个具有抗菌活性的化合物库,
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