鉴定肝细胞癌的新型潜在生物标志物
建立HCC预后circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络。
作者通过单变量、套索和多变量 Cox 回归分析构建了具有 7 个目标 mRNA 的预后特征,其 1、3 和 5 年 AUC 值分别为 0.797、0.733 和 0.721,表明其在 HCC 预后中的敏感性和特异性.
此外,可以在 GSE14520 中验证预后特征。根据7个hub mRNAs与其他RNAs的靶向关系,建立了21个circRNAs、15个lncRNAs、5个miRNAs和7个mRNAs的预后ceRNA网络。
在这项 Aging-US 研究中揭示的网络可能有助于全面阐明驱动 HCC 的 ceRNA 机制,并为评估 HCC 的预后提供新的候选生物标志物。
慧芳亮博士和碧香张博士无论从科技的华中科技大学以及肝,胰,胆系疾病的湖北省重点实验室说,“HCC,作为最常见的一种肝癌,已成为一个癌症相关死亡的主要原因,也是引起广泛关注的全球健康问题。”
他们描述了一个复杂的转录后调控网络,其中circRNAs、lncRNAs和其他RNAs可以与miRNAs竞争并通过共享不少于一个miRNA反应元件来充当天然的miRNA海绵。
由于这些非编码 RNA 和蛋白质编码 mRNA 可以通过 MRE 与 miRNA 结合,因此它们可以与 miRNA 竞争并参与这个复杂网络的调节。
TCGA 或GEO 数据库的RNA 测序数据可以提供各种癌症的circRNA、miRNA 和mRNA 数据,可以成为数据挖掘和生物发现的极好资源。
对于 HCC,预后 lncRNA-miRNA-mRNA 和 circRNA-miRNA-mRNA ceRNA 网络已经发表。
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