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水稻策略改进了遗传碱基编辑器

导读 休斯顿——(2021 年 11 月 11 日)——想让痞子远离基因库派对吗?在他们到达之前潜入并关上门。这是莱斯大学科学家的一项新策略的中心

休斯顿——(2021 年 11 月 11 日)——想让痞子远离基因库派对吗?在他们到达之前潜入并关上门。

这是莱斯大学科学家的一项新策略的中心思想,他们试图通过提前微调特定的CRISPR碱基编辑策略来避免基因编辑错误。

水稻化学和生物分子工程师Xue Sherry Gao和化学家Anatoly Kolomeisky及其实验室将理论和实验相结合,以综合方法构建更好的碱基编辑器,即以单碱基分辨率靶向和修复有缺陷的 DNA 的分子机器。

他们的工作出现在Nature Communications 上。

该论文描述了碱基编辑器用来操纵 DNA 链、在必要时切割它们并为替换代码让路的分子过程。当它起作用时,随着它越来越多地用于治疗镰状细胞性贫血和某些癌症等遗传疾病,编辑器只编辑预期的核苷酸。

如果没有,那是因为旁观者的编辑会导致不良影响。

Rice 策略主要旨在消除对旁观者、与碱基编辑器目标相邻的核苷酸的任性编辑。Gao 的实验室此前引入了工具,可将基于 CRISPR 的胞嘧啶突变编辑的准确性提高6,000 倍。

对于新项目,她聘请了 Kolomeisky 实验室帮助创建一个理论框架,以消除编辑库设计中的反复试验。这些将更好地针对导致疾病的突变,同时避免旁观者。在此过程中,该框架可以帮助科学家更好地了解碱基编辑期间发生的化学和物理过程。

“Sherry 和其他实验科学家已经有了有效的结果,”Kolomeisky 说,他指的是早期的论文,其中实验室使用其编辑器将胞嘧啶转化为胸腺嘧啶,纠正 DNA 突变,同时避免上游易受攻击的胞嘧啶。“但是,尽管取得了这些惊人的发展,但对于我们如何利用这些蛋白质系统来改善编辑,还没有微观理解。”

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