研究人员对可以使家禽生病的耐药肠炎沙门氏菌菌株的基因组进行测序

北卡罗来纳州立大学的研究人员对一种剧毒肠炎沙门氏菌菌株的基因组进行了测序，该菌株连续几年使两个家禽群患病，发现它既具有抗生素抗性，又可能感染人类。对命名为 SE_TAU19 的菌株进行表征，将有助于公共卫生机构追踪爆发和预防暴露。

沙门氏菌有两种，其中一种，肠道沙门氏菌，与人类疾病有关。S. enterica包含超过 2,500 种血清型或细菌群，其中许多可导致人类疾病。沙门氏菌血清型肠炎 (SE) 最常与家禽有关，是全球人类疾病的主要原因。

大多数人类沙门氏菌感染起源于食源性，许多动物(例如鸡)可以携带病原体而不会自己生病。SE_TAU19 在感兴趣的家禽中引起临床疾病的能力 Grayson Walker，DVM 和博士。北卡罗来纳州立大学兽医学院卢克博斯特实验室的学生，也是描述该研究的论文的第一作者。

“我们通常认为沙门氏菌被鸡藏匿而不伤害它们;然而，这种菌株是有毒的，实际上使它们生病了，”沃克说。“我们也知道沙门氏菌喜欢留下来。这种菌株在整个生长期杀死肉鸡，一年后在不同的鸡群中再次出现。因此，我们决定对基因组进行测序，看看哪些抗性和毒力特征使该菌株独一无二。”

研究小组对该菌株的基因组进行了测序，发现它包括 7 个抗菌素耐药基因、120 个毒力基因和一个大毒力质粒。质粒是“可交换的”遗传元件，可以在菌株之间进行交换，使它们更具抗生素抗性或传染性。

“虽然我们不能说它是一种‘新的’沙门氏菌菌株，但我们可以说这种菌株不仅对家禽具有致命性、抗生素耐药性和传染性，而且还可能感染人类，”沃克说。“好消息是，通过对基因组进行测序，我们现在拥有的数据可以帮助确定未来爆发的起源并遏制任何爆发。”

该研究发表在兽医科学前沿，并得到美国农业部动植物卫生检验局国家生物和农业防御设施科学家培训计划的支持。全基因组测序由 FDA GenomeTrakr 项目完成，该项目由 1U18FD00678801 资助，在共同作者 Sid Thakur 的实验室完成，Sid Thakur 是人口健康和病理生物学教授，也是北卡罗来纳州和兽医学院全球健康项目的负责人。北卡罗来纳州立大学兽医解剖病理学副教授博斯特为通讯作者。

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