麻省理工学院的研究人员开发了用于肝脏全基因组研究的新技术
麻省理工学院生物学助理教授克里斯汀·诺斯 (Kristin Knouse) 想要了解肝脏如何实现这种再生,希望了解如何诱导其他器官做同样的事情。为此,她的实验室开发了一种使用基因编辑系统 CRISPR 对小鼠肝脏进行全基因组研究的新方法。
利用这项新技术,研究人员可以研究小鼠基因组中的每个基因如何影响特定的疾病或行为。在一篇描述该技术的论文中,研究人员发现了几个对肝细胞存活和增殖很重要的基因,这些基因以前在实验室培养皿中生长的细胞研究中没有发现。
“如果我们真的想了解哺乳动物的生理学和疾病,我们应该尽可能在活的有机体中研究这些过程,因为这是我们可以在最原始的环境中研究生物学的地方,”Knouse 说,他也是麻省理工学院科赫研究所的成员综合癌症研究所。
Knouse 是这篇新论文的高级作者,该论文今天发表在Cell Genomics上。怀特黑德研究所功能基因组学平台主任 Heather Keys 是该研究的合著者。
作为麻省理工学院的研究生,Knouse 使用再生肝组织作为模型来研究细胞分裂的一个方面,称为染色体分离。在这项研究中,她观察到在肝脏中分裂的细胞与在实验室培养皿中分裂的肝细胞表现不同。
“我从这项研究中了解到,细胞分裂等细胞内在的东西,我们长期以来认为独立于细胞外任何事物的东西,显然受到细胞外环境的影响,”她说。“当我们研究培养细胞时,我们失去了细胞外环境的影响。”
然而,许多类型的研究,包括使用 CRISPR 等技术的全基因组筛选,更难以在整个生物体的规模上部署。CRISPR 基因编辑系统由一种称为 Cas9 的酶组成,它在给定位置切割 DNA,由一条称为向导 RNA 的 RNA 指导。这使得研究人员能够在大量细胞中敲除每个细胞的一个基因。
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