热情有爱心的泰古蜥蜴成为遗传资源

今天发表在《开放获取杂志》上的GigaScience是一篇介绍tegu蜥蜴基因组的文章，它掌握了爬行动物世界中一项非常不寻常的技能：它可以打开自己的加热系统。

大多数爬行动物不能像哺乳动物一样控制自己的体温，而必须依靠自己所处的环境，比如可用的阳光和阴影，才能获得最佳的体温。然而，萨尔瓦托梅里阿纳(Salvator merianae)的特古(Tegu)向血液全面变暖迈出了一步：它可以将体温提高到比周围环境高10摄氏度。tegu的另一个更消极的方面是入侵物种，这对濒危物种构成了严重威胁。虽然它是土生土长的南美雨林和稀树草原，但它迷人的本质——它甚至可以达到一定程度的室内训练，这使它成为一种非常迷人的宠物，深受爬行动物爱好者的喜爱。不幸的是，外来宠物的国际贸易是物种进入新环境的主要原因之一，在新环境中，它们可能会成为当地物种的威胁。鉴于tegu独特的生物特性及其对环境的潜在危险，

德国德累斯顿马克斯普朗克分子细胞生物学和遗传学研究所的迈克尔希勒领导的研究团队提供的tegu基因组序列质量前所未有。为了实现这一目标，研究人员使用最先进的技术读取tegu的DNA并组装其基因组序列。最新发布的梅里阿纳氏菌基因组序列长度超过20亿个DNA字母，包含22000多个基因。这是迄今为止所有爬行动物基因组中最完整的组装，也将帮助科学家研究其他蜥蜴和蛇。

通过使用所谓的“太平洋生物科学”测序技术，研究人员可以克服爬行动物基因组组装中的一些挑战。Hiller和第一作者Juliana Roscito解释说：“像其他爬行动物一样，tegu基因组的很大一部分由重复序列组成，这些序列在基因组中出现了很多次。重复组装是基因组组装中的一个主要问题，尤其是当重复序列比测序的DNA片段的长度更长时，会导致组装中的间隙(断裂)。”

Tegu本身就是一个有趣的模式物种。作者对tegu基因组测序的动机之一实际上与他们对另一类爬行动物的兴趣有关：蛇。作者解释了他们的想法：“我们对研究蛇和其他爬行动物的断肢感兴趣。因为没有四肢的爬行动物的祖先有完全发育的四肢，所以我们需要一个组装良好的四肢完全发育的蜥蜴基因组作为参考”。由于具有测序基因组的爬行动物很少，作者决定自己生产它们。

本文的另一部分，特别考虑到爬行动物缺乏代表性。作为基因组测序的脊椎动物，作者还提供了tegu与其他16个物种的全基因组比较。“我们希望这些资源能够促进比较爬行动物基因组学，从而了解这个物种独特的形态特征是如何进化的，以及脊椎动物基因组是如何进化的，”Michael Hiller和Juliana Roscito总结道。

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