如何绘制与疾病严重程度相关的病毒蛋白图谱？

一群艾滋病研究人员、细胞生物学家和生物物理学家共同支持新冠科学。他们确定了蛋白的原子结构，认为该蛋白有助于病原体逃逸，抑制人体免疫细胞的反应。该结构图现已发表在《PNAS》杂志上，但自8月份以来一直对科学界开放，它为专门为新型量身定制的新型抗病毒治疗奠定了基础，并使进一步研究新出现的病毒对人体的损害成为可能。

“利用X射线晶体学，我们建立了ORF8的原子模型，并突出了两个独特的区域：一个只存在于新型及其直系蝙蝠祖先，另一个没有任何其他。”加州大学伯克利分校教授、前劳伦斯伯克利国家实验室(伯克利实验室)科学家詹姆斯赫尔利说。“这些区域已经稳定了这种蛋白，这种蛋白是一种分泌蛋白，不像病毒的特征蛋白那样与膜结合，产生新的分子间界面。我们研究界的其他人认为这些界面参与了某种程度的反应。新型的致病性高于其进化高度。”

聚焦结构生物学

蛋白质结构图的生成总是费力的，因为科学家必须设计细菌，它可以提取大量的分子，将分子操纵成纯晶体形式，然后对晶体进行多次X射线衍射成像。这些图像——由晶体中原子的X射线束反射并穿过晶格中的间隙，产生斑点图案——通过特殊的软件进行组合和分析，以确定每个原子的位置。根据蛋白质的复杂性，这个艰巨的过程可能需要几年时间。

对于许多蛋白质来说，通过将未溶解分子的结构与具有相似氨基酸序列的其他蛋白质进行比较，有助于构建图谱。科学家可以对蛋白质如何折叠成三维形状做出明智的猜测。

但是对于ORF8来说，团队必须从零开始。ORF8的氨基酸序列与其他蛋白质完全不同，所以科学家对它的整体形状没有参考，而蛋白质的3D形状决定了它的功能。

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