研究人员创建新的人工智能管道来识别分子相互作用

了解蛋白质如何相互作用对于开发新疗法和了解疾病至关重要。得益于计算的进步，由化学助理教授阿尔贝托·佩雷斯领导的研究小组开发了一种算法来识别这些分子相互作用。

佩雷斯的研究团队包括佛罗里达大学的两名研究生 Arup Mondal 和 Bhumika Singh，以及来自罗格斯大学和伦斯勒理工学院的几名研究人员。该团队在Angewandte Chemie 国际版上发表了他们的研究结果。

这种创新工具被命名为 AF-CBA Pipeline，在精确定位特定蛋白质的最强肽结合物方面提供了无与伦比的准确性和速度。它通过使用人工智能模拟分子相互作用来实现这一点，对数千个候选分子进行排序，以确定与感兴趣的蛋白质相互作用最好的分子。

人工智能驱动的方法允许管道执行这些操作，所需时间仅为人类或传统基于物理的方法完成相同任务所需的时间的一小部分。

“把它想象成一家杂货店，”佩雷斯解释道。 “当你想买最好的水果时，你必须比较大小和外观。水果太多了，当然无法全部尝试，所以你需要比较几个然后再做出选择。然而，这种人工智能方法不仅可以都尝试一下，但也能可靠地选出最好的一个。”

通常，感兴趣的蛋白质是当它们行为不当时对我们的身体造成最大损害的蛋白质。通过寻找哪些分子与这些有问题的蛋白质相互作用，该管道为对抗炎症、免疫失调和癌症等疾病的靶向治疗开辟了途径。

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