通过病原体预耐药基因型预测抗生素耐药性

如果通过称为预耐药性的指标来了解抗生素的使用，则可以预防抗生素耐药性。它指的是药物敏感基因型中存在耐药前突变——会出现增加抗生素耐药性风险的突变。

伦敦大学学院(UCL)和大奥蒙德街医院(GOSH)的科学家提出了预抗性概念。在最近的一项研究中，科学家们将他们的概念应用于结核分枝杆菌的基因组特征。本质上，科学家们检查了结核分枝杆菌基因组特征的目录，以产生“对预耐药多态性的首次描述和评估”。

科学家们断言，预测易感病原体未来的耐药性以及针对性的扩大治疗有可能不仅在结核分枝杆菌中，而且在其他病原体中防止耐药性的出现。

该研究的详细结果发表在12月15日《自然通讯》杂志上一篇题为“结核分枝杆菌预耐药的基因组特征”的文章中。文章作者表示，这些发现可以让医生在未来选择细菌感染的最佳治疗方法。

“我们对17年期间采样的3,135个分离株的整个基因组进行了测序，”该文章的作者写道。“在时间校准的系统发育树上重建祖先基因组后，我们开发并应用了全基因组生存分析来确定获得抗性的危险。

“我们证明结核分枝杆菌谱系2比谱系4获得耐药性的风险更高，并估计异烟肼单一耐药性后利福平耐药性进化的风险更高。此外，我们描述了与较高的耐药性获得风险相关的基因座和基因组多态性。”

结核病是由结核分枝杆菌引起的细菌感染，是2020年仅次于COVID-19的第传染病死亡原因，导致150万人死亡。如果使用正确的抗生素治疗，这种疾病是可以治愈的，但治疗时间较长，而且许多高危人群无法获得足够的医疗保健。当人们没有完成整个疗程、或者无法获得药物或药物质量较差时，就会出现耐药结核病。

多重耐药结核病是一个巨大的、不可持续的负担，在少数国家已经发现了完全耐药的菌株。随着卫生系统努力应对这一流行病，全球结核病治疗进展已经放缓。

为了更好地了解结核病并最终提供更好的治疗方法，这项新研究首次确定了如何在耐药突变发生之前预防它们。它还展示了如何将预耐药概念应用于其他传染病。最后，它提出了一种个性化病原体“基因组疗法”的方法。在这种方法中，根据引起疾病的特定病原体的DNA选择药物，防止耐药性的产生。

这项工作是秘鲁利马郊区17年研究的结晶，GOSH传染病顾问、伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所副教授LouisGrandjean博士领导了一个研究小组。

本研究的资深作者Grandjean表示：“我们的抗生素选择已经不多了，而且我们拥有的选择往往是有毒的——我们必须更聪明地使用我们所拥有的东西来预防耐药性。这是第一个表明我们可以战胜耐药性的例子。这将使我们将来能够利用病原体基因组来选择最佳治疗方法。”

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