宾夕法尼亚州立大学研究人员开发基因组资源以识别新病原体

为了加强对可能导致传染病爆发和突发公共卫生事件的新型传染性细菌的早期检测，宾夕法尼亚州立大学农业科学学院的一组研究人员将对 700 种杆菌的基因组进行测序，这些细菌是导致炭疽的生物威胁病原体的近亲.

该研究由美国疾病控制和预防中心提供 120 万美元的资助，该研究将支持联邦机构开发基因组资源和 DNA 序列数据库，以提高其快速检测新病原体的能力，根据团队负责人Jasna Kovac 的说法，食品科学助理教授和 Lester Earl 和 Veronica Casida 食品安全职业发展教授。

“你可能听说过 2001 年的生物恐怖袭击，在邮件中传播了引起炭疽病的炭疽杆菌的孢子，”她说。“吸入这些孢子的人会患上炭疽病，这通常是致命的。”

Kovac 补充说，从生物防御的角度来看，了解可能成为炭疽等新型生物威胁的环境杆菌的多样性非常重要，他在杆菌基因组学方面拥有丰富的经验。

“在蜡状芽孢杆菌群细菌中有一些已知的例子，其中‘良性’环境菌株获得了引起炭疽的能力，”她说。“我们有兴趣检测和表征具有已知生物威胁和无害环境微生物特征的相似芽孢杆菌菌株。”

Kovac 指出，如果及早发现新出现的病原体或生物威胁，它们更有可能被有效控制以防止突发公共卫生事件。“我们正在与 CDC 合作创建一个大型杆菌数据库，以支持其开发快速实验室方法，以检测新型、天然或工程病原体和潜在的新兴生物威胁，”她说。

这些数据库将增强和加强由 CDC 准备和新发感染小组开发的现有基因组学方法和生物信息学管道。Kovac 指出，这将允许快速检测与增加的生物威胁风险相关的基因组标记。

她说：“我们具有独特的优势，可以完成拟议的工作，并支持 CDC 扩展参考数据库以检测新出现的传染病。”“在宾夕法尼亚州立大学的食品科学系，我们拥有微生物学和基因组学专业知识，并且可以获取大量独特的、环境和食物杆菌，这些杆菌保存在由我们在康奈尔大学的合作者管理的食品微生物追踪器培养物收集和数据库中。”

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