多组学方法识别大量与酒精使用障碍相关的候选基因
西奈山伊坎医学院的研究人员使用多组学方法发表了成瘾遗传学领域的第一项此类研究,以提供与饮酒和酒精使用障碍(AUD)相关的大量因果候选基因列表.该研究还显示了酗酒、阿尔茨海默病和其他神经退行性疾病之间的潜在联系。研究结果于 8 月 20 日发表在Nature Communications 上。
酒精使用障碍是复杂的、中等遗传性的精神障碍,与发病率和死亡率升高有关。虽然之前的研究已经确定了与饮酒相关的位点(遗传区域),但本研究旨在确定变异体和基因本身。“鉴定全基因组关联研究 (GWAS) 位点背后的因果变异和基因对于了解酒精使用障碍的生物学和改善其治疗至关重要,”第一和共同通讯作者 Manav Kapoor 说。博士,研究期间西奈山神经科学、遗传学和基因组学助理教授。
为了确定与澳元和每周饮酒量 (DPW) 相关的基因,这是一种用于评估酒精消耗的措施,研究团队整合了多组学数据,使用基于孟德尔随机化的方法对来自脑组织和骨髓的最大可用转录组和表观基因组数据进行了整合细胞。使用来自这些组织的数据,该团队精细定位了复杂基因座并确定了可能的变异和候选基因,包括与酗酒相关的SPI1和MAPT基因。还发现SPI1和MAPT与其他精神和神经退行性疾病的易感性有关,包括抑郁症和阿尔茨海默病。
SPI1(Spi-1 Proto-Oncogene) 编码 ETS 域转录因子 (PU.1),可在髓样和 B 淋巴样细胞发育和体内平衡过程中调节基因表达。鉴于SPI1控制了几个下游基因的表达,正如在过去对人类和动物大脑的转录组学分析中所观察到的那样,该基因可能是在饮酒行为中丰富免疫途径的一个主要原因。
研究中分析的MAPT基因编码 tau 蛋白,该蛋白以其在中枢神经系统疾病中的作用而闻名,例如阿尔茨海默病、额颞叶痴呆、帕金森病和其他称为 tauopathies 的神经退行性疾病。
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