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SARS-CoV-2变体如何牺牲紧密结合来逃避抗体

最近在南非出现的具有高度传染性的SARS-CoV-2变种(称为B.1.351)使科学家们想知道如何改进现有的疫苗和疗法以确保得到强有力的保护。现在,研究人员在ACS的《药物化学杂志》上发表的报告已经使用计算机建模来揭示,使B.1.351变异体不同于原始SARS-CoV-2的三个突变之一降低了病毒与人细胞的结合力,但有可能使其逃脱某些抗体。

自从在2019年末首次发现原始的SARS-CoV-2以来,出现了几种新变种,包括来自英国,南非和巴西的变种。由于新的变体似乎具有更高的传播性,因此迅速传播,许多人担心它们会破坏当前的疫苗,抗体疗法或自然免疫力。B.1.351变体带有两个突变(N501Y和E484K),可以增强刺突蛋白的受体结合域(RBD)与人ACE2受体之间的结合。但是,第三种突变(K417N;第417位的赖氨酸至天冬酰胺突变)令人费解,因为它消除了RBD和ACE2之间的良好相互作用。所以,

研究人员使用分子动力学模拟分析了变种B.1.351中K417N突变的后果。首先,他们模拟了原始SARS-CoV-2 RBD与ACE2之间以及RBD与CB6之间的结合,RBD与CB6是从康复的患者中分离出的SARS-CoV-2中和抗体。他们发现,RBD中第417位的原始氨基酸赖氨酸与CB6的相互作用比与ACE2的相互作用更强,这与该抗体在动物模型中的治疗功效一致。然后,研究小组对与K417N变体的结合进行了建模,该变体将赖氨酸改变为天冬酰胺。尽管此突变降低了RBD与ACE2之间的结合强度,但它在更大程度上降低了RBD与CB6和其他几种人抗体的结合。因此,变体B.1。351似乎已经牺牲了与ACE2的紧密结合,以逃避免疫系统。研究人员说,当科学家们致力于加强对当前疫苗和疗法的保护时,这些信息可能被证明是有用的。

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