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招募信息理论可以帮助科学家发现癌症基因

Johns Hopkins Medicine和Johns Hopkins Kimmel Cancer Center的科学家们使用了一个广泛研究的数学领域,其主要目的是研究如何测量,存储和共享数字信息和其他形式的信息,他们发现了急性发展中可能的关键基因元凶。淋巴细胞白血病(ALL)。

ALL是儿童白血病的最常见形式,仅在,每年就有约3,000名儿童和青少年罹患这种疾病。

具体地说,约翰·霍普金斯大学的团队使用“信息论”,进行了一种基于零和一的字符串(计算机语言和代码通用的二进制符号系统)的分析,以识别特定过程的变量或结果。就人类癌症生物学而言,科学家们专注于细胞中称为DNA甲基化的化学过程,该过程中某些化学基团附着在指导基因打开/关闭开关的基因区域。

约翰霍普金斯大学医学院彭博杰出教授安德鲁·费恩伯格(Andrew Feinberg)博士说:“这项研究证明了癌症的数学语言如何帮助我们理解细胞应该如何行为以及这种行为的改变如何影响我们的健康。”,怀廷工程学院和彭博公共卫生学院。费恩伯格是癌症表观遗传学领域的创始人,他在1980年代发现了癌症中DNA甲基化的改变。

Feinberg和他的团队说,使用信息论来寻找癌症驱动基因可能适用于多种癌症和其他疾病。

如今,甲基化被认为是不改变细胞遗传密码即可改变DNA的一种方法。当甲基化在这种表观遗传现象中出现问题时,某些基因会异常打开或关闭,从而引发不受控制的细胞生长或癌症。

“大多数人都熟悉DNA的遗传变化,即改变DNA序列的突变。这些突变就像是组成句子的单词,而甲基化就像是句子中的标点符号,在我们阅读时提供了停顿和停止的机会,”他说。芬伯格。为了寻找一种新的,更有效的方式来阅读和理解由DNA甲基化改变的表观遗传密码,他与John Goutsias博士合作。约翰·霍普金斯大学电气与计算机工程系教授,医学博士Michael Koldobskiy博士。是约翰·霍普金斯·金梅尔癌症中心的儿科肿瘤学家兼肿瘤学助理教授。

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